46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3032 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  285  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  40.66 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3033  hypothetical protein  38.79 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000104497  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  46.38 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  37.08 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  46.27 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  38.1 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  34.74 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  44.16 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  44.16 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  44.16 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  40.54 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  45.76 
 
 		 282 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  39.51 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  37.88 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  41.56 
 
 		 254 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  35.44 
 
 		 484 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  34.34 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  39.24 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3808  hypothetical protein  37.18 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  40.28 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  39.44 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  32.56 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  32.47 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  43.42 
 
 		 218 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1337  hypothetical protein  30.61 
 
 		 266 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2057  hypothetical protein  39.18 
 
 		 97 aa  43.5  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3589  hypothetical protein  34.86 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793233  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1253  hypothetical protein  25.33 
 
 		 172 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4199  hypothetical protein  35.9 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112437  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2299  hypothetical protein  32.61 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.233786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2591  hypothetical protein  27.33 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000331884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.67 
 
 		 320 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.67 
 
 		 320 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41.67 
 
 		 320 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0242  hypothetical protein  34.38 
 
 		 339 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3585  hypothetical protein  39.19 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.050073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2652  hypothetical protein  32.76 
 
 		 924 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  36.17 
 
 		 236 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  36.96 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  34.41 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.63 
 
 		 438 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  33.77 
 
 		 1089 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  33.77 
 
 		 1093 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  33.77 
 
 		 1093 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>