24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3589 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3589  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  324  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793233  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  61.69 
 
 
172 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3040  hypothetical protein  57.14 
 
 
200 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3099  hypothetical protein  57.14 
 
 
200 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0223818  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3056  hypothetical protein  57.14 
 
 
200 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  43.16 
 
 
205 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3808  hypothetical protein  36 
 
 
210 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4199  hypothetical protein  35.42 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112437  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  34.44 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  41.25 
 
 
219 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  34.86 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  32 
 
 
236 aa  51.2  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  34.58 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  32.64 
 
 
209 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.21 
 
 
438 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  36.46 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  30.49 
 
 
104 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0029  hypothetical protein  40.3 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0564693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  36.9 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  32.08 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0847  hypothetical protein  34.17 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0948898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  40.48 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  32.31 
 
 
249 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  34.65 
 
 
133 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>