25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2179 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  317  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  34.91 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  41.03 
 
 
219 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  38.37 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  38.89 
 
 
137 aa  57.8  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  47.22 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.36 
 
 
438 aa  54.3  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  37.14 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2223  hypothetical protein  41.18 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3808  hypothetical protein  43.75 
 
 
210 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  34.91 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0673  hypothetical protein  34.41 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00478481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  34.82 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  36.88 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2859  hypothetical protein  31.91 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3589  hypothetical protein  39.24 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793233  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  32.84 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  38.53 
 
 
105 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01100  hypothetical protein  35.63 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  30.36 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  32.41 
 
 
209 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2591  hypothetical protein  25.81 
 
 
138 aa  41.2  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000331884  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  33.72 
 
 
178 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25630  hypothetical protein  33 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  36.96 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>