26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1385 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 		 105 aa  197  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  49.28 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  46.07 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  40.59 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  41.18 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  39 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2142  hypothetical protein  42.11 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2057  hypothetical protein  44.74 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  41.18 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  41.98 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2859  hypothetical protein  40.24 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  35.96 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  38.89 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  45.31 
 
 		 254 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  49.09 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  35.48 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  45.35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 		 594 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  46 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  38.53 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3033  hypothetical protein  37.8 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000104497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  37.8 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2652  hypothetical protein  33.75 
 
 		 924 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  41.03 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0242  hypothetical protein  38.75 
 
 		 339 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  35.44 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>