23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0133 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  100 
 
 
163 aa  303  9.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0271  hypothetical protein  48.82 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01100  hypothetical protein  40.71 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  40.32 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  35.94 
 
 
484 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  38.1 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  34.29 
 
 
228 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  31.05 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  36.62 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  39.51 
 
 
129 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  38.74 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  47.3 
 
 
254 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  29.52 
 
 
2179 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  36.42 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  32.1 
 
 
974 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  46.03 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  37.12 
 
 
236 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  39.36 
 
 
207 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  37.75 
 
 
323 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  30.09 
 
 
2272 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  27.91 
 
 
133 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  30.99 
 
 
209 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8906  hypothetical protein  28.11 
 
 
214 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>