87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0435 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  615  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0079  protein of unknown function DUF1112  57.06 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.735437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3124  hypothetical protein  42.31 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000741155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11090  transmembrane protein  46.1 
 
 		 278 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00918655  normal  0.405264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4385  hypothetical protein  42.4 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4229  hypothetical protein  42.4 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132482  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4154  hypothetical protein  42.4 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1614  protein of unknown function DUF1112  43.8 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3154  protein of unknown function DUF1112  37.18 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.254668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8572  hypothetical protein  40.77 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0937  hypothetical protein  36.65 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1053  protein of unknown function DUF1112  41.58 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.933646  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0697  protein of unknown function DUF1112  40.22 
 
 		 269 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0928  protein of unknown function DUF1112  40.76 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1043  protein of unknown function DUF1112  37.59 
 
 		 261 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.968328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1232  protein of unknown function DUF1112  40.07 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1159  hypothetical protein  40.07 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05030  predicted membrane protein  37.79 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0906  hypothetical protein  41.42 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0849  hypothetical protein  41.04 
 
 		 271 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.148418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4679  hypothetical protein  38.61 
 
 		 283 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0753806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2038  hypothetical protein  37.78 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20707  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08040  predicted membrane protein  30.97 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170017  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07090  predicted membrane protein  32.37 
 
 		 277 aa  129  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1080  protein of unknown function DUF1112  35 
 
 		 283 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0922  protein of unknown function DUF1112  35.61 
 
 		 272 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0943972  normal  0.459659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08120  predicted membrane protein  36.21 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4424  protein of unknown function DUF1112  36.11 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.938126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1826  hypothetical protein  34.38 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194611  normal  0.0800768 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1059  protein of unknown function DUF1112  29.8 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2672  protein of unknown function DUF1112  35.47 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2205  hypothetical protein  36.55 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2299  hypothetical protein  36.55 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4008  protein of unknown function DUF1112  31.47 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1232  hypothetical protein  33.62 
 
 		 257 aa  99  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0813  hypothetical protein  31.72 
 
 		 265 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734486  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2587  protein of unknown function DUF1112  37.06 
 
 		 249 aa  96.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1813  hypothetical protein  32.78 
 
 		 243 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.560392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0619  hypothetical protein  32.3 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.887697 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1103  hypothetical protein  33.77 
 
 		 272 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312011  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0088  hypothetical protein  33.05 
 
 		 247 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00170259  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1614  hypothetical protein  31.2 
 
 		 243 aa  93.2  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0744977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31920  predicted membrane protein  35.06 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0724336  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1900  protein of unknown function DUF1112  36.53 
 
 		 276 aa  93.2  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.731906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1644  hypothetical protein  30.08 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000319229  hitchhiker  0.000785706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1466  hypothetical protein  28.81 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205564  hitchhiker  0.0000276724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02484  hypothetical protein  33.47 
 
 		 253 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0833  protein of unknown function DUF1112  37.97 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2001  hypothetical protein  32.78 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000219658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1153  protein of unknown function DUF1112  36.07 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.771607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3916  hypothetical protein  29.06 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1618  hypothetical protein  29.71 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.506655  hitchhiker  0.00000000806776 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2226  hypothetical protein  35.52 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000010453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3144  hypothetical protein  35.52 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000710256  normal  0.0132365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2174  hypothetical protein  35.52 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000207906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2309  hypothetical protein  35.52 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000311917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2191  hypothetical protein  35.52 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2011  hypothetical protein  35.52 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000505565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1983  hypothetical protein  35.52 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.45076e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1965  hypothetical protein  35.52 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000219502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2165  hypothetical protein  35.52 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000608319  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2434  hypothetical protein  31.88 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1614  hypothetical protein  34.05 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000915108  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0083  hypothetical protein  33.64 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  41.77 
 
 		 1803 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  42.05 
 
 		 830 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  39.57 
 
 		 514 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  45 
 
 		 751 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  51.25 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1262  hypothetical protein  30.06 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00222992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1461  hypothetical protein  28.99 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0477327  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  33.33 
 
 		 218 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  33.33 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  43.27 
 
 		 224 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  56.45 
 
 		 428 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  68.75 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02086  Nuclear pore complex protein An-Nup159 (Eurofung)  33.33 
 
 		 1394 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.919136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  60.53 
 
 		 172 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1469  hypothetical protein  45.56 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000606848  normal  0.0260491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0272  membrane protein  25.9 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000292393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4422  hypothetical protein  54.72 
 
 		 409 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67249  1,3-beta-D-glucan synthase subunit (BGS3) (GSC2)  31.68 
 
 		 1889 aa  42.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.660291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>