19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0938 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0873  hypothetical protein  36.13 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  32.92 
 
 		 323 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3438  hypothetical protein  35.8 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1469  hypothetical protein  30.87 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000606848  normal  0.0260491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  37.18 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  61.7 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3212  hypothetical protein  50.77 
 
 		 335 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1159  hypothetical protein  40.18 
 
 		 308 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  39.13 
 
 		 1299 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0079  protein of unknown function DUF1112  47.95 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.735437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4069  hypothetical protein  34.22 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  41.56 
 
 		 1131 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.13 
 
 		 1310 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2934  hypothetical protein  54.05 
 
 		 121 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1379  hypothetical protein  52.27 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  39.13 
 
 		 1310 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  31.25 
 
 		 685 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5164  hypothetical protein  47.69 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>