54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0052 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  391  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  49.44 
 
 
190 aa  141  7e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  61.45 
 
 
109 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  46.67 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  34.88 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  48.48 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  51.85 
 
 
107 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  31.78 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  51.85 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  50 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  54.32 
 
 
133 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  49.18 
 
 
148 aa  63.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  36.36 
 
 
146 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  45.59 
 
 
137 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  40.48 
 
 
161 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  47.62 
 
 
117 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  44 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  39.42 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  47.06 
 
 
131 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  47.06 
 
 
111 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  47.06 
 
 
111 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  45.71 
 
 
92 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  45.31 
 
 
159 aa  54.7  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  40.21 
 
 
176 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  62.71 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  33.62 
 
 
305 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  46.43 
 
 
146 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  40.21 
 
 
161 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  34.11 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  35.09 
 
 
393 aa  51.6  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  42.25 
 
 
116 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 
92 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04595  An-Nup2 Nuclear pore complex protein (Eurofung)  35.77 
 
 
512 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1604  hypothetical protein  40.91 
 
 
124 aa  49.7  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  41.79 
 
 
99 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  34.68 
 
 
3242 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  32.43 
 
 
133 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  38.76 
 
 
218 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  40.46 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  40.46 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  40.46 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  40.46 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  40.46 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  40.46 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  38.3 
 
 
88 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  34.21 
 
 
154 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  37.14 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67249  1,3-beta-D-glucan synthase subunit (BGS3) (GSC2)  29.57 
 
 
1889 aa  42.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.660291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  36.92 
 
 
323 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1379  hypothetical protein  37.1 
 
 
288 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  22.94 
 
 
685 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  51.52 
 
 
514 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  48.65 
 
 
79 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  66.67 
 
 
364 aa  41.2  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>