19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1806 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1353    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  31.36 
 
 		 331 aa  56.2  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5713  predicted protein  29.31 
 
 		 154 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0609583  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1160  hypothetical protein  35.16 
 
 		 566 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 441 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  23.81 
 
 		 848 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  27.65 
 
 		 228 aa  50.8  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  43.14 
 
 		 1056 aa  50.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0558  hypothetical protein  39.44 
 
 		 243 aa  47.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.362885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  47.5 
 
 		 476 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  31.94 
 
 		 355 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3628  hypothetical protein  31.94 
 
 		 331 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04595  An-Nup2 Nuclear pore complex protein (Eurofung)  48.65 
 
 		 512 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2421  hypothetical protein  27.63 
 
 		 172 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0389814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1151  hypothetical protein  31.43 
 
 		 350 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07380  hypothetical protein  37.35 
 
 		 289 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5164  hypothetical protein  32.18 
 
 		 276 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 998 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.18 
 
 		 14916 aa  44.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>