17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21920 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  40.93 
 
 		 334 aa  88.6  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2255  hypothetical protein  36.73 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00280705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04420  hypothetical protein  44.3 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.916304  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2471  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.938497  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12126  hypothetical protein  37.59 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.438535  normal  0.428494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2172  hypothetical protein  39.44 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3439  hypothetical protein  34.12 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.34044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3096  hypothetical protein  32.79 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21209  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21900  hypothetical protein  43.75 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115858  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  53.62 
 
 		 514 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35 
 
 		 14916 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36010  hypothetical protein  35.71 
 
 		 99 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2515  hypothetical protein  32.47 
 
 		 140 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173464  hitchhiker  0.00244818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2252  hypothetical protein  39.51 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000962337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13530  hypothetical protein  40 
 
 		 636 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.323412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  39.36 
 
 		 163 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>