14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12126 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12126  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  475  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.438535  normal  0.428494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2477  hypothetical protein  63.77 
 
 
262 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2522  hypothetical protein  63.77 
 
 
262 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2514  hypothetical protein  63.77 
 
 
262 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302435  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3096  hypothetical protein  66.93 
 
 
255 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21209  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3439  hypothetical protein  73.5 
 
 
264 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.34044  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  36.89 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2471  hypothetical protein  41.53 
 
 
324 aa  75.5  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.938497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  40.7 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2255  hypothetical protein  36.6 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00280705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04420  hypothetical protein  32.82 
 
 
138 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.916304  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21900  hypothetical protein  43.48 
 
 
136 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115858  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24120  hypothetical protein  76.47 
 
 
322 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2515  hypothetical protein  36 
 
 
140 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173464  hitchhiker  0.00244818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>