14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04420  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  285  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.916304  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  42.52 
 
 		 207 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2471  hypothetical protein  39.24 
 
 		 324 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.938497  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2172  hypothetical protein  35.8 
 
 		 227 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12126  hypothetical protein  32.82 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.438535  normal  0.428494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2255  hypothetical protein  38.16 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00280705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21900  hypothetical protein  42.03 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115858  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2515  hypothetical protein  35.06 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173464  hitchhiker  0.00244818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  30.49 
 
 		 334 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36010  hypothetical protein  33.67 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2477  hypothetical protein  27.34 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2522  hypothetical protein  27.34 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2514  hypothetical protein  27.34 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302435  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3096  hypothetical protein  32.04 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21209  normal  0.335335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>