17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2952 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  617  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  40.43 
 
 		 207 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2515  hypothetical protein  59.21 
 
 		 140 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173464  hitchhiker  0.00244818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12126  hypothetical protein  38.46 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.438535  normal  0.428494 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2471  hypothetical protein  36.86 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.938497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3096  hypothetical protein  37.93 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21209  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  45.09 
 
 		 514 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2172  hypothetical protein  42.61 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04420  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.916304  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0153  hypothetical protein  44.36 
 
 		 784 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2255  hypothetical protein  32.18 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00280705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  61.64 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21900  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115858  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  43.51 
 
 		 830 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67249  1,3-beta-D-glucan synthase subunit (BGS3) (GSC2)  39.8 
 
 		 1889 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.660291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  50 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30140  hypothetical protein  41.75 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>