16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2471 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2471  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.938497  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12126  hypothetical protein  42.96 
 
 
244 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.438535  normal  0.428494 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  37.2 
 
 
207 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2255  hypothetical protein  40.82 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00280705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3096  hypothetical protein  43.86 
 
 
255 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21209  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3439  hypothetical protein  45.35 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.34044  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2477  hypothetical protein  39.69 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2522  hypothetical protein  39.69 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2514  hypothetical protein  39.69 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302435  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2172  hypothetical protein  43.84 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04420  hypothetical protein  39.24 
 
 
138 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.916304  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  36.76 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21900  hypothetical protein  45.21 
 
 
136 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115858  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36010  hypothetical protein  32.58 
 
 
99 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2515  hypothetical protein  35.53 
 
 
140 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173464  hitchhiker  0.00244818 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67249  1,3-beta-D-glucan synthase subunit (BGS3) (GSC2)  32.28 
 
 
1889 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.660291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>