14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2172 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  441  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  35.29 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12126  hypothetical protein  31.54 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.438535  normal  0.428494 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2471  hypothetical protein  43.84 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.938497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2477  hypothetical protein  38.17 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2522  hypothetical protein  38.17 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2514  hypothetical protein  38.17 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302435  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04420  hypothetical protein  35.8 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.916304  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2255  hypothetical protein  39.47 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00280705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3096  hypothetical protein  37.3 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21209  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  40.26 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21900  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115858  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3439  hypothetical protein  29.77 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.34044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36010  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>