15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3439 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3439  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.34044  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3096  hypothetical protein  76.32 
 
 
255 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21209  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12126  hypothetical protein  50.85 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.438535  normal  0.428494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2477  hypothetical protein  78.69 
 
 
262 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2522  hypothetical protein  78.69 
 
 
262 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2514  hypothetical protein  78.69 
 
 
262 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302435  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  38 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2471  hypothetical protein  34.47 
 
 
324 aa  75.5  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.938497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  39.38 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2255  hypothetical protein  36.36 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00280705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21900  hypothetical protein  40 
 
 
136 aa  55.8  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115858  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2172  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2230  hypothetical protein  52.94 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0675867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04420  hypothetical protein  29.08 
 
 
138 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.916304  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  29.82 
 
 
1107 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>