12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2515 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2515  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173464  hitchhiker  0.00244818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2952  hypothetical protein  59.21 
 
 
334 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000079303  hitchhiker  0.000181549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04420  hypothetical protein  35.06 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.916304  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2471  hypothetical protein  35.53 
 
 
324 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.938497  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12126  hypothetical protein  36 
 
 
244 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.438535  normal  0.428494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2477  hypothetical protein  35.71 
 
 
262 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2522  hypothetical protein  35.71 
 
 
262 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2514  hypothetical protein  35.71 
 
 
262 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302435  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21900  hypothetical protein  32 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115858  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21920  hypothetical protein  32.47 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  0.21627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36010  hypothetical protein  31.31 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3439  hypothetical protein  37.5 
 
 
264 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.34044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>