More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3259 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  100 
 
 		 830 aa  1686    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  39.16 
 
 		 539 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  37.12 
 
 		 581 aa  333  8e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3405  type II and III secretion system protein  40.15 
 
 		 594 aa  325  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  39.09 
 
 		 569 aa  325  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  38.31 
 
 		 625 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  38.31 
 
 		 546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  29.58 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  26.83 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  27.51 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.39 
 
 		 572 aa  165  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  26.06 
 
 		 614 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  26.04 
 
 		 554 aa  154  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.17 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.52 
 
 		 506 aa  151  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0500  type II secretion system protein, putative  24.89 
 
 		 500 aa  150  7e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  25.18 
 
 		 530 aa  150  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  23.85 
 
 		 508 aa  148  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  25.73 
 
 		 544 aa  147  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.29 
 
 		 577 aa  146  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24 
 
 		 558 aa  145  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.93 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  25.55 
 
 		 546 aa  138  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.48 
 
 		 550 aa  138  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.33 
 
 		 559 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  25.05 
 
 		 561 aa  137  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.36 
 
 		 559 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  22.77 
 
 		 506 aa  136  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  25.71 
 
 		 585 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.23 
 
 		 559 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.23 
 
 		 559 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.28 
 
 		 561 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.05 
 
 		 561 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  23.04 
 
 		 549 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.05 
 
 		 561 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  24.52 
 
 		 609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  25.47 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.44 
 
 		 556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  29.36 
 
 		 560 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.52 
 
 		 562 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.07 
 
 		 563 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  22.92 
 
 		 463 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  28.57 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27 
 
 		 567 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  29.45 
 
 		 559 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  27.03 
 
 		 563 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  31.21 
 
 		 783 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  31.76 
 
 		 829 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  21.76 
 
 		 541 aa  113  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  29.61 
 
 		 686 aa  112  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  30.82 
 
 		 833 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  30.25 
 
 		 803 aa  108  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  30.45 
 
 		 779 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  30.87 
 
 		 740 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  27.85 
 
 		 681 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  30.48 
 
 		 784 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  28.72 
 
 		 803 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  29.59 
 
 		 767 aa  104  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.86 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  21.66 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  27.18 
 
 		 720 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  21.66 
 
 		 470 aa  101  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  27.81 
 
 		 819 aa  100  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  22.17 
 
 		 470 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  29.48 
 
 		 751 aa  100  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  29.57 
 
 		 791 aa  99  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  26.37 
 
 		 673 aa  99  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  28.04 
 
 		 803 aa  99  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  31.06 
 
 		 787 aa  98.6  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  29.19 
 
 		 810 aa  98.6  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  26.22 
 
 		 781 aa  98.2  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  28.04 
 
 		 801 aa  97.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  29.78 
 
 		 745 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  27.45 
 
 		 926 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  25.91 
 
 		 781 aa  96.3  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  29.69 
 
 		 527 aa  95.1  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  29.77 
 
 		 717 aa  95.1  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  27.25 
 
 		 736 aa  95.1  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  26.35 
 
 		 789 aa  94.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  26.64 
 
 		 946 aa  94.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  28.33 
 
 		 793 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  28.81 
 
 		 805 aa  93.2  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  26.77 
 
 		 783 aa  91.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  32.35 
 
 		 814 aa  91.3  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  29.29 
 
 		 774 aa  90.9  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  26.27 
 
 		 733 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  27.33 
 
 		 804 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  25.88 
 
 		 807 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  29.82 
 
 		 758 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  25.17 
 
 		 635 aa  89  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  28.12 
 
 		 744 aa  89  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  27.88 
 
 		 728 aa  88.6  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  27.11 
 
 		 797 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  27.67 
 
 		 738 aa  88.6  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  27.76 
 
 		 702 aa  88.2  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  23.53 
 
 		 799 aa  87.8  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  25.34 
 
 		 763 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  27.08 
 
 		 870 aa  87.4  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  27.14 
 
 		 776 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  27.15 
 
 		 703 aa  87  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>