More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4150 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  100 
 
 
829 aa  1644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  55.45 
 
 
819 aa  827    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  57.1 
 
 
720 aa  782    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  31.96 
 
 
773 aa  333  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  33.1 
 
 
763 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  33.71 
 
 
745 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  31.69 
 
 
780 aa  316  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  31.34 
 
 
751 aa  316  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  32.53 
 
 
681 aa  311  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  30.79 
 
 
775 aa  308  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  30.49 
 
 
775 aa  307  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  31.62 
 
 
774 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  28.55 
 
 
801 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  29.09 
 
 
803 aa  280  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  38.44 
 
 
833 aa  247  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  27.88 
 
 
772 aa  231  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  28.25 
 
 
793 aa  227  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  37.85 
 
 
805 aa  208  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  28.1 
 
 
733 aa  207  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  27.28 
 
 
789 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  38.19 
 
 
767 aa  201  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  35.42 
 
 
797 aa  197  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  36.78 
 
 
686 aa  196  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  35.31 
 
 
766 aa  194  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  28.76 
 
 
787 aa  185  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  26.06 
 
 
752 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  30.57 
 
 
733 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  36.97 
 
 
751 aa  171  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  35.1 
 
 
779 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  32.7 
 
 
776 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  27.2 
 
 
781 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  25.62 
 
 
728 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  27.06 
 
 
781 aa  165  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  25.92 
 
 
750 aa  164  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  27.71 
 
 
807 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 
757 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 
750 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  27.02 
 
 
803 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  27.03 
 
 
771 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 
757 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  26.9 
 
 
777 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 
757 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 
757 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 
757 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  26.54 
 
 
757 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  26.64 
 
 
783 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  25.39 
 
 
793 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  26.89 
 
 
814 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  27.43 
 
 
783 aa  153  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  35.78 
 
 
650 aa  152  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  35.78 
 
 
654 aa  152  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  35.38 
 
 
654 aa  151  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  25.73 
 
 
744 aa  150  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  24.69 
 
 
717 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  26.23 
 
 
803 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  23.43 
 
 
696 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  26.68 
 
 
803 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  31.33 
 
 
711 aa  144  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  24.16 
 
 
736 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  26.19 
 
 
787 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  30.03 
 
 
710 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  28.77 
 
 
704 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  24.38 
 
 
748 aa  138  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  32.05 
 
 
662 aa  138  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.66 
 
 
894 aa  137  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  30.57 
 
 
805 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  29.08 
 
 
706 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  27.87 
 
 
705 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  29.19 
 
 
700 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  29.19 
 
 
700 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  30.77 
 
 
794 aa  135  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  32.75 
 
 
660 aa  134  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  30.03 
 
 
703 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  32.33 
 
 
640 aa  134  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  28.45 
 
 
705 aa  134  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  29.71 
 
 
704 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  22.18 
 
 
892 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  31.67 
 
 
640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  32.86 
 
 
696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  28.72 
 
 
702 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  29.08 
 
 
703 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  30.09 
 
 
710 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  33.45 
 
 
658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  28.22 
 
 
804 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  30.19 
 
 
655 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  28.92 
 
 
686 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  28.92 
 
 
686 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  28.92 
 
 
686 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  28.92 
 
 
686 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  34.47 
 
 
864 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  29.39 
 
 
724 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  30.43 
 
 
716 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  27.62 
 
 
714 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  28.84 
 
 
689 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  28.53 
 
 
705 aa  129  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  28.11 
 
 
686 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  30.86 
 
 
675 aa  128  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  32.38 
 
 
645 aa  128  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  30.21 
 
 
658 aa  127  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  29.63 
 
 
740 aa  127  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>