More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3768 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  73.31 
 
 		 561 aa  811    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  72.91 
 
 		 560 aa  794    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  72.86 
 
 		 559 aa  791    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  76.25 
 
 		 567 aa  838    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  73.48 
 
 		 559 aa  796    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  69.89 
 
 		 561 aa  763    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  73.3 
 
 		 558 aa  790    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  76.34 
 
 		 562 aa  832    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  73.48 
 
 		 559 aa  798    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  72.86 
 
 		 559 aa  791    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  72.89 
 
 		 549 aa  768    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  73.31 
 
 		 561 aa  811    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  73.31 
 
 		 561 aa  810    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  79.14 
 
 		 563 aa  860    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  76.08 
 
 		 556 aa  842    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  100 
 
 		 556 aa  1127    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  54.63 
 
 		 609 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  50.71 
 
 		 546 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  49.07 
 
 		 530 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  47.77 
 
 		 544 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  49.64 
 
 		 559 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  52.59 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  44.93 
 
 		 569 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  44.47 
 
 		 537 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  42.94 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  40.25 
 
 		 572 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  39.59 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  38.13 
 
 		 538 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  36.96 
 
 		 614 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  37.48 
 
 		 585 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  37.69 
 
 		 577 aa  319  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  27.59 
 
 		 625 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  28.26 
 
 		 506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3405  type II and III secretion system protein  27.8 
 
 		 594 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  27.97 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  25.28 
 
 		 539 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  27.33 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  28.72 
 
 		 547 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  25.31 
 
 		 470 aa  147  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  29.73 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  26.32 
 
 		 581 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.77 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  24.69 
 
 		 470 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  27.37 
 
 		 541 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  24.69 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  27.45 
 
 		 563 aa  137  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  26.97 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.68 
 
 		 830 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  25.26 
 
 		 463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.19 
 
 		 574 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  34.21 
 
 		 641 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  29.8 
 
 		 686 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  25.69 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  30.37 
 
 		 716 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  30.88 
 
 		 781 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  30 
 
 		 797 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  30.53 
 
 		 781 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  29.81 
 
 		 662 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  27.69 
 
 		 751 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0500  type II secretion system protein, putative  23.68 
 
 		 500 aa  105  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  29.21 
 
 		 740 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  27.22 
 
 		 810 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  30.82 
 
 		 763 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  23.84 
 
 		 726 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  30.38 
 
 		 794 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  27.47 
 
 		 736 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.07 
 
 		 776 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  31.29 
 
 		 745 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  28.34 
 
 		 892 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  27.6 
 
 		 787 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  29.62 
 
 		 602 aa  98.6  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  26.86 
 
 		 697 aa  98.2  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  27.99 
 
 		 703 aa  97.8  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  27.48 
 
 		 696 aa  97.8  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  28.35 
 
 		 686 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  27.1 
 
 		 738 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  28.35 
 
 		 686 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  28.05 
 
 		 686 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  27.27 
 
 		 712 aa  95.1  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  28.35 
 
 		 686 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  28.05 
 
 		 686 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  26.18 
 
 		 675 aa  95.1  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  28.67 
 
 		 781 aa  94.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  27.38 
 
 		 704 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  26.96 
 
 		 635 aa  94.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  27.46 
 
 		 752 aa  93.6  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  28.25 
 
 		 724 aa  93.6  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  29.93 
 
 		 710 aa  93.6  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  30.5 
 
 		 658 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  28.98 
 
 		 789 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  28.91 
 
 		 640 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  29.25 
 
 		 640 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  28.62 
 
 		 710 aa  93.2  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  28.33 
 
 		 1421 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  28.95 
 
 		 747 aa  93.2  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  27.11 
 
 		 819 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  28.62 
 
 		 714 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  26.69 
 
 		 705 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  27.46 
 
 		 672 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  27.83 
 
 		 710 aa  92.8  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>