More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1384 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 563 aa  1129    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  33.7 
 
 		 541 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  35.95 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  33.21 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  33.21 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  33.08 
 
 		 508 aa  248  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  32.95 
 
 		 470 aa  247  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  32.95 
 
 		 470 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  32.95 
 
 		 470 aa  243  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  30.32 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  27.27 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  25.75 
 
 		 569 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  26.1 
 
 		 543 aa  150  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  26.94 
 
 		 546 aa  149  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  29.27 
 
 		 559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.54 
 
 		 572 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  27.74 
 
 		 530 aa  146  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  26.33 
 
 		 544 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.65 
 
 		 561 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.65 
 
 		 561 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.65 
 
 		 561 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  23.95 
 
 		 537 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.33 
 
 		 559 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.33 
 
 		 559 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.76 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  30.25 
 
 		 560 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.85 
 
 		 559 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.85 
 
 		 559 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.29 
 
 		 567 aa  136  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  27.29 
 
 		 549 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.28 
 
 		 550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.86 
 
 		 562 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  24.9 
 
 		 614 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.37 
 
 		 556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.65 
 
 		 558 aa  130  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.28 
 
 		 577 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.29 
 
 		 556 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  26.57 
 
 		 585 aa  130  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.12 
 
 		 563 aa  127  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  28.73 
 
 		 546 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  24.75 
 
 		 561 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  29.09 
 
 		 569 aa  118  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  22.97 
 
 		 625 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  26.53 
 
 		 539 aa  117  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.03 
 
 		 830 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  25.81 
 
 		 609 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  26.9 
 
 		 819 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3405  type II and III secretion system protein  26.85 
 
 		 594 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  22.94 
 
 		 547 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  26.93 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  31.89 
 
 		 527 aa  99.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.18 
 
 		 574 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  23.95 
 
 		 987 aa  97.1  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  29.69 
 
 		 660 aa  97.1  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  28.17 
 
 		 829 aa  96.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  27.74 
 
 		 495 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  34.46 
 
 		 602 aa  94.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  30.1 
 
 		 416 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  30.28 
 
 		 881 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  35 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  27.33 
 
 		 641 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  29.9 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  25.34 
 
 		 479 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  26.84 
 
 		 729 aa  90.5  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  26.74 
 
 		 681 aa  89.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  28.16 
 
 		 657 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  29.59 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  33.16 
 
 		 657 aa  88.2  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 781 aa  88.2  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  22.97 
 
 		 781 aa  87.4  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  24.84 
 
 		 693 aa  87.4  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  24.05 
 
 		 736 aa  87  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  25.07 
 
 		 689 aa  87  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  31.22 
 
 		 655 aa  87  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  29.44 
 
 		 492 aa  87  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  25.78 
 
 		 740 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  29.57 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  29.41 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  30.22 
 
 		 636 aa  85.9  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  26.29 
 
 		 697 aa  85.9  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  29.57 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  29.57 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  29.57 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  29.57 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  29.11 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  28.42 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  29.57 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  28.49 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  26.13 
 
 		 915 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  25.87 
 
 		 1421 aa  84.7  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  29.69 
 
 		 787 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  28.64 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  30.9 
 
 		 689 aa  84.3  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  30.04 
 
 		 630 aa  84  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  28.28 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  31.5 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  28.99 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  33.33 
 
 		 804 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  28.8 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>