More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2414 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  100 
 
 
657 aa  1330    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  43.43 
 
 
749 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  43.49 
 
 
667 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  41.19 
 
 
656 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  47.65 
 
 
754 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  46.78 
 
 
698 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  41.34 
 
 
760 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  41.48 
 
 
614 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  39.54 
 
 
653 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  44.68 
 
 
667 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  41.13 
 
 
789 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  41.46 
 
 
734 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  40.58 
 
 
662 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  39.7 
 
 
625 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  37.56 
 
 
621 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  38.45 
 
 
621 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  38.27 
 
 
621 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  42.16 
 
 
615 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  33.96 
 
 
812 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  34.6 
 
 
868 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  34.32 
 
 
822 aa  313  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  33.44 
 
 
870 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  36.36 
 
 
796 aa  306  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  33.06 
 
 
861 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  32.49 
 
 
779 aa  303  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  33.66 
 
 
767 aa  286  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3789  type II and III secretion system protein  34.9 
 
 
596 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  31.47 
 
 
769 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  35.48 
 
 
792 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  25.59 
 
 
764 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  37.05 
 
 
881 aa  133  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  26.33 
 
 
944 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  25.12 
 
 
589 aa  127  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  25.59 
 
 
891 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  27.3 
 
 
1421 aa  124  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  25.68 
 
 
808 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  24.4 
 
 
926 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  26.13 
 
 
987 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  29.17 
 
 
733 aa  120  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  24.76 
 
 
946 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  25.74 
 
 
870 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  25.9 
 
 
580 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  24.07 
 
 
893 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  28.81 
 
 
775 aa  117  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  24.32 
 
 
864 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  28.48 
 
 
775 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  25.36 
 
 
693 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  24.07 
 
 
882 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.07 
 
 
887 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.37 
 
 
887 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  27.49 
 
 
673 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  29.58 
 
 
641 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  25.3 
 
 
616 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  24.82 
 
 
575 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  31.34 
 
 
494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  24.82 
 
 
527 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.7 
 
 
894 aa  110  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  23.99 
 
 
547 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 
451 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  25.25 
 
 
591 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  24.82 
 
 
462 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  24.82 
 
 
462 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  24.82 
 
 
576 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  24.82 
 
 
462 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  24.82 
 
 
465 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0540  type IV pilus secretin PilQ  25.43 
 
 
636 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.614076  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  22.96 
 
 
426 aa  107  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  26.2 
 
 
635 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  25.59 
 
 
573 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  27.96 
 
 
445 aa  107  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  26.02 
 
 
543 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  31.8 
 
 
679 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  31.54 
 
 
451 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  27.94 
 
 
696 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  24.83 
 
 
682 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  24.94 
 
 
689 aa  106  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  28.09 
 
 
787 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  23.97 
 
 
717 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  25.88 
 
 
684 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  25.88 
 
 
684 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  26.59 
 
 
670 aa  105  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  23.92 
 
 
692 aa  105  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  27.3 
 
 
747 aa  105  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  29.1 
 
 
484 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  25.78 
 
 
543 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  25.65 
 
 
684 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  24.75 
 
 
567 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  29.48 
 
 
457 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6875  type II and III secretion system protein  25.83 
 
 
561 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  24.64 
 
 
1269 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  22.9 
 
 
718 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  28.28 
 
 
482 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  22.38 
 
 
704 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  30.08 
 
 
686 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  29.39 
 
 
663 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  26.63 
 
 
553 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  29.57 
 
 
745 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.61 
 
 
483 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  28.2 
 
 
657 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  30.54 
 
 
690 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>