More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6875 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2920  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  78.43 
 
 		 595 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6875  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 561 aa  1126    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4345  type II and III secretion system protein  68.12 
 
 		 451 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  37.04 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  32.92 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  32.51 
 
 		 479 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  33.17 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  32.64 
 
 		 436 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0246  type II and III secretion system protein  30.05 
 
 		 714 aa  190  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  31.19 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2117  type II and III secretion system protein  28.66 
 
 		 356 aa  140  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  28.54 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  27.23 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  27.23 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  29.64 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  28.06 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  26.7 
 
 		 482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  28.77 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  26.81 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  25.7 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  27.75 
 
 		 491 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  31.32 
 
 		 479 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  29.15 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  27.19 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  27.78 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  33.97 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  27.61 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  37.69 
 
 		 526 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  33.59 
 
 		 460 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  25.56 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  29.77 
 
 		 468 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  27.79 
 
 		 493 aa  124  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  26.52 
 
 		 530 aa  124  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  29.77 
 
 		 454 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  26.04 
 
 		 622 aa  123  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  29.11 
 
 		 457 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  31.94 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  25.63 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  25.29 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  32.23 
 
 		 473 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  25.98 
 
 		 484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  27.53 
 
 		 539 aa  120  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  28.35 
 
 		 620 aa  120  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  32.1 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  27.17 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  26.98 
 
 		 663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  27.76 
 
 		 416 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  26.85 
 
 		 461 aa  117  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  32.64 
 
 		 482 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  32.64 
 
 		 492 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  32.64 
 
 		 482 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  32.64 
 
 		 482 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  28.2 
 
 		 502 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  32.64 
 
 		 482 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  28.18 
 
 		 483 aa  116  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  32.64 
 
 		 482 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  32.64 
 
 		 482 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  27.15 
 
 		 700 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  26.07 
 
 		 455 aa  115  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  27.46 
 
 		 657 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  38.04 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  28.86 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  39.27 
 
 		 419 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  27.74 
 
 		 502 aa  114  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  24.94 
 
 		 514 aa  114  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  27.91 
 
 		 451 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  26.58 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  26.58 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  27.06 
 
 		 479 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  25.05 
 
 		 574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  27.82 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  27.82 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  24.32 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  26.08 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  27.2 
 
 		 633 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  26.24 
 
 		 652 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  27.82 
 
 		 646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  27.52 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  27.16 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  27.75 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  27.72 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  27.72 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  27.75 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  27.75 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  27.72 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  27.72 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  25.26 
 
 		 492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  24.78 
 
 		 507 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  26.85 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  25.62 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  27.27 
 
 		 656 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  27.13 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  27.08 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  27.59 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  28.42 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  27.75 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  27.25 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>