More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29100 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  63.86 
 
 		 621 aa  738    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  64.37 
 
 		 621 aa  741    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  63.74 
 
 		 615 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  63.34 
 
 		 621 aa  732    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  64.12 
 
 		 625 aa  745    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 614 aa  1234    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  45.33 
 
 		 656 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  44.5 
 
 		 760 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  42.3 
 
 		 667 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  45.59 
 
 		 667 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  41.88 
 
 		 749 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  41.61 
 
 		 657 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  43.33 
 
 		 754 aa  435  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  38.1 
 
 		 653 aa  435  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  43.1 
 
 		 662 aa  389  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  40.59 
 
 		 789 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  43.27 
 
 		 698 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  40.77 
 
 		 734 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  35.28 
 
 		 812 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  33.9 
 
 		 861 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  33.22 
 
 		 868 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  33.22 
 
 		 822 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  32.51 
 
 		 870 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  33.44 
 
 		 796 aa  296  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  33.62 
 
 		 779 aa  291  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  32.62 
 
 		 769 aa  289  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  32.3 
 
 		 767 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3789  type II and III secretion system protein  34.05 
 
 		 596 aa  250  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  31.14 
 
 		 792 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 764 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  28.01 
 
 		 1421 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  27.87 
 
 		 589 aa  122  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  26.74 
 
 		 693 aa  120  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  26.83 
 
 		 870 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  24.17 
 
 		 891 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  26.53 
 
 		 580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 946 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  25.25 
 
 		 944 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  25.96 
 
 		 683 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  27.4 
 
 		 683 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  25.96 
 
 		 683 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  24.95 
 
 		 704 aa  112  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  25.96 
 
 		 683 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  26.41 
 
 		 684 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  26.41 
 
 		 684 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  26.12 
 
 		 682 aa  111  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  27.31 
 
 		 547 aa  111  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  24.52 
 
 		 926 aa  111  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2522  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 619 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.417958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  27.17 
 
 		 682 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  26.41 
 
 		 684 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.12 
 
 		 685 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  25.73 
 
 		 683 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  31.84 
 
 		 752 aa  108  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  29.25 
 
 		 745 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.19 
 
 		 684 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  23.01 
 
 		 578 aa  107  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  26.04 
 
 		 413 aa  107  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.92 
 
 		 894 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  25.73 
 
 		 683 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  26.65 
 
 		 688 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  24.21 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  26.13 
 
 		 716 aa  105  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  25.65 
 
 		 682 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  26.1 
 
 		 689 aa  104  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  23.71 
 
 		 987 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  25.53 
 
 		 660 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  25.68 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  27.04 
 
 		 640 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  25.3 
 
 		 426 aa  101  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  25.96 
 
 		 683 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  24.94 
 
 		 460 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  24.94 
 
 		 458 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  29.31 
 
 		 655 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  26.6 
 
 		 640 aa  101  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  24.62 
 
 		 882 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  24.94 
 
 		 500 aa  100  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.28 
 
 		 887 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  25.72 
 
 		 424 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  23.79 
 
 		 887 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  27.34 
 
 		 655 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  28.97 
 
 		 641 aa  98.2  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  26.3 
 
 		 751 aa  97.8  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  25.06 
 
 		 698 aa  97.8  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  25.06 
 
 		 698 aa  97.4  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  29.21 
 
 		 686 aa  97.8  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  27.92 
 
 		 714 aa  97.4  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  29.08 
 
 		 670 aa  95.9  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  24.3 
 
 		 711 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  27.6 
 
 		 658 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  23.49 
 
 		 756 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  24.29 
 
 		 718 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  23.93 
 
 		 692 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  23.13 
 
 		 864 aa  94.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  30.77 
 
 		 1302 aa  94.4  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  24.02 
 
 		 717 aa  94.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  27.59 
 
 		 758 aa  94  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.25 
 
 		 561 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  26.2 
 
 		 719 aa  93.2  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  28.31 
 
 		 658 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>