More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1043 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 589 aa  1191    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  27.29 
 
 		 668 aa  132  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0540  type IV pilus secretin PilQ  26.27 
 
 		 636 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.614076  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  23.33 
 
 		 578 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  25.12 
 
 		 657 aa  127  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  25.69 
 
 		 1421 aa  127  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  23.77 
 
 		 580 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  24.83 
 
 		 726 aa  125  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  25.24 
 
 		 887 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  26.93 
 
 		 682 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  25.88 
 
 		 754 aa  124  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  23.33 
 
 		 712 aa  124  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  24.16 
 
 		 887 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  23.56 
 
 		 717 aa  123  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  25.24 
 
 		 882 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.12 
 
 		 685 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  25.57 
 
 		 812 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  25.36 
 
 		 944 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  27.62 
 
 		 614 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  24.16 
 
 		 734 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  24.84 
 
 		 683 aa  120  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 682 aa  120  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  25.15 
 
 		 657 aa  120  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  25.68 
 
 		 656 aa  120  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.49 
 
 		 706 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  23.93 
 
 		 692 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  23.98 
 
 		 636 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  25.29 
 
 		 682 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  24.89 
 
 		 684 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  23.33 
 
 		 718 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  24.23 
 
 		 683 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  25.59 
 
 		 704 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  24.8 
 
 		 711 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  24.89 
 
 		 684 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  25.19 
 
 		 864 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  24.89 
 
 		 684 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  25 
 
 		 789 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.85 
 
 		 718 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  24.4 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  24.37 
 
 		 714 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  23.78 
 
 		 683 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  23.84 
 
 		 689 aa  117  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  23.78 
 
 		 683 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  23.78 
 
 		 683 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  25.56 
 
 		 870 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  23.78 
 
 		 683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.57 
 
 		 684 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  24.6 
 
 		 717 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  24.63 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  25.17 
 
 		 688 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  23.67 
 
 		 630 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  26.59 
 
 		 946 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  26.34 
 
 		 926 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.46 
 
 		 874 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  24.21 
 
 		 706 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.46 
 
 		 894 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  24.71 
 
 		 721 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  24.49 
 
 		 721 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  25.42 
 
 		 710 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  24.52 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  23.13 
 
 		 683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  23.86 
 
 		 696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  22.72 
 
 		 893 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  24.01 
 
 		 715 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  23.64 
 
 		 696 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  24.43 
 
 		 573 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  24.75 
 
 		 591 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 891 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  24.83 
 
 		 538 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  24.7 
 
 		 710 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  23.36 
 
 		 547 aa  110  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  23.81 
 
 		 711 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  22.91 
 
 		 723 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  23.9 
 
 		 714 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  25.12 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  26.04 
 
 		 915 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  24.34 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  27.05 
 
 		 625 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  25.18 
 
 		 667 aa  107  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  23.12 
 
 		 710 aa  107  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  23.88 
 
 		 749 aa  106  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  22.5 
 
 		 712 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  23.27 
 
 		 655 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  23.01 
 
 		 714 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  23.84 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  24.04 
 
 		 716 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  22.69 
 
 		 721 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  22.96 
 
 		 412 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  24.15 
 
 		 729 aa  105  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  24.16 
 
 		 543 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  24.59 
 
 		 462 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  24.32 
 
 		 760 aa  104  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  24.59 
 
 		 462 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  22.96 
 
 		 412 aa  104  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  24.59 
 
 		 462 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  24.59 
 
 		 465 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  22.96 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  22.72 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  24.4 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  25.91 
 
 		 621 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>