More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1941 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  100 
 
 
729 aa  1467    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  44.76 
 
 
711 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  43.59 
 
 
710 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  40.08 
 
 
726 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  40.14 
 
 
717 aa  495  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  42.94 
 
 
715 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  41.52 
 
 
716 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  42.36 
 
 
699 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  38.83 
 
 
723 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  40.17 
 
 
718 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  41.52 
 
 
710 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  40.72 
 
 
710 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  41.14 
 
 
696 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  41 
 
 
696 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  39.89 
 
 
706 aa  482  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  38.44 
 
 
710 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  40.81 
 
 
729 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  39.14 
 
 
718 aa  479  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  39.11 
 
 
745 aa  473  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  38.29 
 
 
714 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  40.84 
 
 
712 aa  472  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  40.28 
 
 
692 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  39.42 
 
 
717 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  39.45 
 
 
712 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  39.38 
 
 
706 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  39.48 
 
 
711 aa  462  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  38.81 
 
 
714 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  40.87 
 
 
704 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  39.25 
 
 
721 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  37.18 
 
 
698 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  37.18 
 
 
698 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  39.71 
 
 
727 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  39.28 
 
 
714 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  42.13 
 
 
694 aa  449  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  38.98 
 
 
721 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  39.12 
 
 
721 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 
668 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  41.15 
 
 
657 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  40.67 
 
 
636 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  36.97 
 
 
683 aa  412  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  36.22 
 
 
684 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  38.45 
 
 
684 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  36.66 
 
 
682 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  41.54 
 
 
655 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  41.55 
 
 
630 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.77 
 
 
684 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  38.92 
 
 
715 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  37.9 
 
 
684 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.56 
 
 
685 aa  405  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  38.43 
 
 
683 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  37.04 
 
 
683 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  37.04 
 
 
683 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  37.04 
 
 
683 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  36.87 
 
 
683 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  37.4 
 
 
683 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  38.05 
 
 
688 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  37.04 
 
 
682 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  36.47 
 
 
682 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  33.57 
 
 
689 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  38.1 
 
 
784 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  38.1 
 
 
784 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.16 
 
 
706 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  38.86 
 
 
578 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  39.14 
 
 
547 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  37.02 
 
 
792 aa  361  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  40.97 
 
 
580 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  35.52 
 
 
756 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  43.5 
 
 
420 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  35.15 
 
 
642 aa  347  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  38.69 
 
 
583 aa  340  7e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  42.89 
 
 
420 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  39.89 
 
 
582 aa  330  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  42.22 
 
 
420 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  40.58 
 
 
422 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  37.73 
 
 
591 aa  308  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  37.73 
 
 
567 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  38.22 
 
 
576 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  37.99 
 
 
616 aa  303  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  37.99 
 
 
527 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  37.99 
 
 
575 aa  303  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  37.73 
 
 
462 aa  302  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  37.73 
 
 
462 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  37.73 
 
 
462 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  37.73 
 
 
465 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  36.96 
 
 
543 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  36.76 
 
 
523 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  36.51 
 
 
543 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  36.36 
 
 
543 aa  296  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  36.43 
 
 
553 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  37.98 
 
 
891 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  35.97 
 
 
553 aa  292  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.74 
 
 
874 aa  290  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  31.16 
 
 
944 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  35.23 
 
 
573 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  39.07 
 
 
893 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  39.18 
 
 
894 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  32.1 
 
 
870 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  38.99 
 
 
882 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  36.84 
 
 
926 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  38.77 
 
 
887 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>