More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2028 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  100 
 
 		 894 aa  1791    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  49.47 
 
 		 946 aa  782    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  49.67 
 
 		 926 aa  795    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  50.93 
 
 		 944 aa  882    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  57.8 
 
 		 870 aa  980    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  43.53 
 
 		 891 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  42.74 
 
 		 864 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.41 
 
 		 874 aa  445  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  34.5 
 
 		 893 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  36.29 
 
 		 882 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  38.1 
 
 		 887 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  38.1 
 
 		 887 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  31.18 
 
 		 987 aa  302  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  40.38 
 
 		 710 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  33.9 
 
 		 1269 aa  290  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  31.87 
 
 		 704 aa  290  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  32.74 
 
 		 711 aa  287  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  31.45 
 
 		 714 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  39.86 
 
 		 718 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  33.05 
 
 		 721 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  33.05 
 
 		 721 aa  284  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  31.69 
 
 		 696 aa  281  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  31.69 
 
 		 696 aa  280  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  39 
 
 		 718 aa  280  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  33.98 
 
 		 655 aa  280  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  30.19 
 
 		 756 aa  277  5e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  39.23 
 
 		 692 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  39.18 
 
 		 729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  32.78 
 
 		 717 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  32.41 
 
 		 706 aa  273  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  39.63 
 
 		 717 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  38.79 
 
 		 710 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  29.43 
 
 		 792 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  29 
 
 		 694 aa  271  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  35.76 
 
 		 710 aa  271  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  32.4 
 
 		 719 aa  270  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  36.51 
 
 		 698 aa  269  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  36.51 
 
 		 698 aa  270  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  30.67 
 
 		 689 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  31.41 
 
 		 706 aa  267  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  35.53 
 
 		 657 aa  266  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  37.86 
 
 		 712 aa  265  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  31.96 
 
 		 712 aa  264  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  33.39 
 
 		 668 aa  263  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  36.82 
 
 		 710 aa  262  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  37.14 
 
 		 693 aa  261  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  29.2 
 
 		 714 aa  260  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  30.27 
 
 		 715 aa  260  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  30.1 
 
 		 699 aa  259  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  30.72 
 
 		 716 aa  259  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  36.91 
 
 		 721 aa  258  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  32.6 
 
 		 636 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  28.8 
 
 		 683 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  29.5 
 
 		 726 aa  256  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  32 
 
 		 630 aa  256  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  37.5 
 
 		 578 aa  256  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  37.93 
 
 		 714 aa  255  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  33.69 
 
 		 784 aa  254  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  33.69 
 
 		 784 aa  254  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  30.45 
 
 		 642 aa  252  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  37.38 
 
 		 683 aa  252  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  30.33 
 
 		 706 aa  251  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  29.62 
 
 		 683 aa  251  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  34.39 
 
 		 684 aa  251  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  36.45 
 
 		 683 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  36.45 
 
 		 683 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  36.45 
 
 		 683 aa  250  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  34.39 
 
 		 684 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  34.39 
 
 		 684 aa  250  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  37.8 
 
 		 688 aa  249  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  36.52 
 
 		 683 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  29.19 
 
 		 723 aa  248  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.75 
 
 		 684 aa  248  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0540  type IV pilus secretin PilQ  36.99 
 
 		 636 aa  248  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.614076  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  32.66 
 
 		 547 aa  247  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.41 
 
 		 685 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  36.21 
 
 		 422 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  36.52 
 
 		 580 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  36.75 
 
 		 682 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  31.47 
 
 		 682 aa  239  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  28.3 
 
 		 729 aa  238  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  28.63 
 
 		 682 aa  238  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  34.4 
 
 		 420 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  36.7 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  34.8 
 
 		 420 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  34.8 
 
 		 420 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  34.87 
 
 		 575 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  27.81 
 
 		 727 aa  233  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  35.41 
 
 		 567 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  35.66 
 
 		 591 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  34.87 
 
 		 616 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  34.43 
 
 		 465 aa  231  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  34.87 
 
 		 527 aa  231  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  34.87 
 
 		 462 aa  230  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  34.87 
 
 		 462 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  34.87 
 
 		 462 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  34.32 
 
 		 711 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  33.58 
 
 		 424 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  35.87 
 
 		 808 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  35.31 
 
 		 523 aa  226  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>