More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4114 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  73.65 
 
 
682 aa  1032    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  75.95 
 
 
685 aa  1056    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  78.48 
 
 
683 aa  1096    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  54.89 
 
 
706 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  89.05 
 
 
684 aa  1233    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  100 
 
 
683 aa  1375    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  89.75 
 
 
683 aa  1244    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  98.39 
 
 
683 aa  1355    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  79.36 
 
 
683 aa  1109    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  74.08 
 
 
682 aa  1018    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  98.54 
 
 
683 aa  1355    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  90.95 
 
 
684 aa  1257    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  98.39 
 
 
683 aa  1355    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  90.66 
 
 
684 aa  1253    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  77.57 
 
 
682 aa  1086    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  77.31 
 
 
688 aa  1075    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  91.24 
 
 
684 aa  1262    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  48.07 
 
 
689 aa  615  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  57.39 
 
 
580 aa  601  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  55.83 
 
 
547 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  52.04 
 
 
578 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  50.81 
 
 
583 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  44.41 
 
 
699 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  51 
 
 
582 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  41.47 
 
 
698 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  41.32 
 
 
698 aa  482  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  39.77 
 
 
704 aa  479  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  38.87 
 
 
711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  37.78 
 
 
718 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  38.54 
 
 
723 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  39.94 
 
 
694 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  39.97 
 
 
710 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.22 
 
 
718 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  37.35 
 
 
692 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  37.64 
 
 
727 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  38.12 
 
 
717 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  40.19 
 
 
668 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  36.43 
 
 
710 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  37.87 
 
 
710 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  36.53 
 
 
706 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  37.09 
 
 
710 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  36.8 
 
 
696 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  36.61 
 
 
696 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  37.75 
 
 
706 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  37.82 
 
 
717 aa  425  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  39.7 
 
 
714 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  36.59 
 
 
715 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  39.8 
 
 
721 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  36.03 
 
 
714 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  36.61 
 
 
716 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  37.29 
 
 
712 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  39.8 
 
 
721 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  35.75 
 
 
721 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  38.03 
 
 
712 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  35.47 
 
 
714 aa  402  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  36.87 
 
 
729 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  36.39 
 
 
729 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  35.44 
 
 
726 aa  395  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  40.07 
 
 
756 aa  389  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  35.45 
 
 
745 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  38.95 
 
 
792 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  37.95 
 
 
784 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  34.91 
 
 
711 aa  369  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  37.95 
 
 
784 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  35.81 
 
 
655 aa  358  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  37.06 
 
 
636 aa  356  7.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  35.85 
 
 
657 aa  353  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  36.88 
 
 
630 aa  352  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  34.67 
 
 
642 aa  333  6e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  42.93 
 
 
420 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  43.17 
 
 
413 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  33.28 
 
 
715 aa  323  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  42.09 
 
 
424 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  43.26 
 
 
422 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  42.41 
 
 
420 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  42.65 
 
 
420 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  41.36 
 
 
424 aa  297  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  40.69 
 
 
426 aa  294  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  37.33 
 
 
553 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  37.1 
 
 
553 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  37.18 
 
 
543 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  37.35 
 
 
543 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  40.49 
 
 
433 aa  289  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  41.69 
 
 
458 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  41.69 
 
 
460 aa  288  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  41.69 
 
 
500 aa  287  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  37.88 
 
 
573 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  32.17 
 
 
944 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  37.07 
 
 
523 aa  280  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.21 
 
 
874 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  37.8 
 
 
465 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  37.8 
 
 
462 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  37.8 
 
 
462 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  37.8 
 
 
462 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  37.8 
 
 
616 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  37.8 
 
 
527 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  37.8 
 
 
575 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  36.51 
 
 
543 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  36.59 
 
 
567 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  37.56 
 
 
576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>