More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3109 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  59.97 
 
 
715 aa  817    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  56.06 
 
 
714 aa  741    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  56.92 
 
 
721 aa  733    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  55.71 
 
 
706 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  57.78 
 
 
696 aa  803    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  57.92 
 
 
696 aa  803    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  63.14 
 
 
714 aa  856    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  57.06 
 
 
721 aa  734    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  65.48 
 
 
710 aa  900    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  64.03 
 
 
717 aa  899    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  54.1 
 
 
710 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  66.89 
 
 
726 aa  946    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  55.43 
 
 
712 aa  776    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  58.71 
 
 
716 aa  807    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  63.08 
 
 
712 aa  840    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 
721 aa  1437    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  47.91 
 
 
723 aa  630  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  48.64 
 
 
711 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  47.35 
 
 
715 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  44.21 
 
 
745 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  44.79 
 
 
711 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  43.72 
 
 
718 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  42.52 
 
 
710 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  42.37 
 
 
699 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  42.56 
 
 
692 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  43.17 
 
 
718 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  40.87 
 
 
710 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  41.67 
 
 
714 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  42.15 
 
 
706 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  41.2 
 
 
704 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  39 
 
 
727 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  39.6 
 
 
729 aa  462  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  37.13 
 
 
698 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  37.13 
 
 
698 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  38.99 
 
 
717 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  37.91 
 
 
694 aa  445  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.21 
 
 
684 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  38.64 
 
 
729 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  37.22 
 
 
683 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  37.41 
 
 
684 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  37.13 
 
 
683 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  36.17 
 
 
684 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  37.22 
 
 
683 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  37.1 
 
 
683 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  37.25 
 
 
684 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  36.99 
 
 
683 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.61 
 
 
685 aa  422  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  36.9 
 
 
683 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  42.12 
 
 
784 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  42.12 
 
 
784 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  36.15 
 
 
683 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  36.46 
 
 
689 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  36.71 
 
 
688 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  36.65 
 
 
682 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  36.84 
 
 
682 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  37.33 
 
 
668 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.88 
 
 
706 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  37.29 
 
 
682 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  40.19 
 
 
655 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  33.12 
 
 
792 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  46.12 
 
 
523 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  39.13 
 
 
636 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  39.39 
 
 
630 aa  382  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  32.81 
 
 
756 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  45.41 
 
 
567 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  45.39 
 
 
527 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  45.39 
 
 
575 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  45.39 
 
 
462 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  45.16 
 
 
576 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  45.85 
 
 
591 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  45.39 
 
 
462 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  45.39 
 
 
616 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  45.39 
 
 
462 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  44.82 
 
 
465 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  44.47 
 
 
553 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  44.2 
 
 
553 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  43.3 
 
 
543 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  38.58 
 
 
657 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  43.88 
 
 
543 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  44.3 
 
 
543 aa  365  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  38.48 
 
 
547 aa  361  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  43.12 
 
 
573 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  39.18 
 
 
578 aa  360  7e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  39.69 
 
 
580 aa  356  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  38.65 
 
 
583 aa  336  7.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.72 
 
 
582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  44.47 
 
 
371 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  39.07 
 
 
420 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  31.36 
 
 
874 aa  296  8e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  39.82 
 
 
420 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  40.04 
 
 
420 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  39.48 
 
 
422 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  31.7 
 
 
642 aa  290  9e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  32.86 
 
 
887 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  33.14 
 
 
882 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  32.71 
 
 
887 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  28.07 
 
 
944 aa  276  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  30.36 
 
 
894 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  30.99 
 
 
893 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  31.68 
 
 
926 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>