More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0399 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  100 
 
 		 642 aa  1298    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  50.24 
 
 		 792 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  45.31 
 
 		 756 aa  495  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  34.26 
 
 		 727 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  39.2 
 
 		 704 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  35.15 
 
 		 729 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  35.26 
 
 		 683 aa  346  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  34.76 
 
 		 723 aa  346  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  35.24 
 
 		 689 aa  345  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  35.04 
 
 		 711 aa  343  8e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  35.3 
 
 		 682 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.21 
 
 		 706 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  34.25 
 
 		 682 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  33.39 
 
 		 683 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  34.98 
 
 		 684 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  34.81 
 
 		 684 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  34.69 
 
 		 683 aa  335  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  34.81 
 
 		 684 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  34.67 
 
 		 683 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  34.47 
 
 		 688 aa  333  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.99 
 
 		 685 aa  332  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  35.48 
 
 		 699 aa  332  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  34.11 
 
 		 683 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  34.11 
 
 		 683 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  33.83 
 
 		 718 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  34.11 
 
 		 683 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  34.86 
 
 		 706 aa  331  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.81 
 
 		 684 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  34.83 
 
 		 710 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.73 
 
 		 718 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  34.95 
 
 		 729 aa  327  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  35.3 
 
 		 668 aa  327  6e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  36.93 
 
 		 698 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  34.42 
 
 		 717 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  36.93 
 
 		 698 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  35.37 
 
 		 692 aa  324  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  36.56 
 
 		 694 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  34.01 
 
 		 710 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  32.41 
 
 		 710 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  34.47 
 
 		 714 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  35.56 
 
 		 682 aa  316  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  31.86 
 
 		 714 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  38.33 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 717 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  35 
 
 		 580 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  31.72 
 
 		 706 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  31.69 
 
 		 712 aa  303  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  35.5 
 
 		 547 aa  303  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  33.16 
 
 		 721 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  33.16 
 
 		 721 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  33.22 
 
 		 710 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  31.54 
 
 		 712 aa  301  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  37.84 
 
 		 420 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  38.05 
 
 		 420 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  32.94 
 
 		 784 aa  298  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  32.94 
 
 		 784 aa  298  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  32.81 
 
 		 578 aa  294  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  32.99 
 
 		 716 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  35.82 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  31.87 
 
 		 721 aa  291  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  30.72 
 
 		 715 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  31.69 
 
 		 726 aa  286  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  32.21 
 
 		 657 aa  286  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  31.69 
 
 		 655 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  33.24 
 
 		 636 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  32.02 
 
 		 696 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  31.56 
 
 		 696 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  32.94 
 
 		 630 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  32.21 
 
 		 745 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  30.62 
 
 		 714 aa  280  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  32.94 
 
 		 583 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  32.2 
 
 		 711 aa  276  9e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  32.98 
 
 		 944 aa  263  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  32.94 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  32.92 
 
 		 893 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  31.85 
 
 		 926 aa  252  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  30.45 
 
 		 894 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  32.43 
 
 		 693 aa  252  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  31.85 
 
 		 946 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  31.91 
 
 		 870 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  30.88 
 
 		 523 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  31.39 
 
 		 591 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  31.39 
 
 		 567 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  30.82 
 
 		 891 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  34.17 
 
 		 719 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  30.98 
 
 		 874 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  32.51 
 
 		 887 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  32.3 
 
 		 887 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  31.51 
 
 		 424 aa  234  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  32.1 
 
 		 882 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  29.55 
 
 		 527 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  29.55 
 
 		 575 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  30.89 
 
 		 543 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  29.55 
 
 		 616 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  29.55 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  29.55 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  29.55 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  29.55 
 
 		 465 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  31.18 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  32.26 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>