More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0734 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  50.95 
 
 		 714 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  59.33 
 
 		 726 aa  808    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  100 
 
 		 696 aa  1402    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  52.6 
 
 		 706 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  57.78 
 
 		 721 aa  801    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  62.95 
 
 		 710 aa  880    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  99.14 
 
 		 696 aa  1392    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  62.55 
 
 		 717 aa  863    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  51.35 
 
 		 710 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  69.41 
 
 		 712 aa  970    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  74.75 
 
 		 715 aa  1041    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  52.84 
 
 		 721 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  52.99 
 
 		 721 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  64.94 
 
 		 712 aa  877    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  62.79 
 
 		 714 aa  845    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  72.21 
 
 		 716 aa  999    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  49.12 
 
 		 711 aa  606  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  45.47 
 
 		 723 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  44.88 
 
 		 715 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  44.48 
 
 		 745 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  43.19 
 
 		 711 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  43.67 
 
 		 699 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  41.42 
 
 		 710 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  40.59 
 
 		 718 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  41.28 
 
 		 729 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  39.92 
 
 		 718 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  38.9 
 
 		 692 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  39.45 
 
 		 727 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  38.77 
 
 		 710 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  39.36 
 
 		 698 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  39.36 
 
 		 698 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  39.5 
 
 		 706 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  38.8 
 
 		 714 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  41.64 
 
 		 704 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  38.24 
 
 		 729 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  38.5 
 
 		 694 aa  442  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.58 
 
 		 685 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  39.29 
 
 		 717 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  37.17 
 
 		 683 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.48 
 
 		 684 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  37.52 
 
 		 683 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  36.95 
 
 		 683 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  36.95 
 
 		 683 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  36.76 
 
 		 683 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  37.87 
 
 		 684 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  37.83 
 
 		 684 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  37.72 
 
 		 682 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  38.02 
 
 		 684 aa  425  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  37.48 
 
 		 683 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  39.87 
 
 		 668 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  35.99 
 
 		 688 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  36.82 
 
 		 683 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  35.42 
 
 		 682 aa  416  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  37.31 
 
 		 682 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  40.19 
 
 		 689 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.53 
 
 		 706 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  32.13 
 
 		 792 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  37.57 
 
 		 756 aa  371  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  39.41 
 
 		 578 aa  369  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  39.26 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  43.4 
 
 		 576 aa  366  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  45.26 
 
 		 465 aa  364  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  45.26 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  45.26 
 
 		 527 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  45.26 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  45.26 
 
 		 462 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  45.26 
 
 		 616 aa  364  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  45.26 
 
 		 575 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  36.18 
 
 		 784 aa  363  6e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  36.18 
 
 		 784 aa  363  6e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  37.62 
 
 		 657 aa  362  9e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  38.67 
 
 		 580 aa  362  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  36.93 
 
 		 655 aa  362  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  44.58 
 
 		 523 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  44.65 
 
 		 567 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  43.84 
 
 		 591 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  37.3 
 
 		 636 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  37.32 
 
 		 630 aa  355  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  38.1 
 
 		 583 aa  336  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  42.14 
 
 		 553 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  42.14 
 
 		 553 aa  334  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  41.78 
 
 		 543 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  41.9 
 
 		 543 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  41.55 
 
 		 543 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.45 
 
 		 582 aa  327  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  41 
 
 		 573 aa  324  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  31.61 
 
 		 944 aa  301  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  39.49 
 
 		 420 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  31.95 
 
 		 874 aa  296  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  32.02 
 
 		 642 aa  291  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  40.09 
 
 		 420 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  40.09 
 
 		 420 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  39.95 
 
 		 422 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  42.22 
 
 		 371 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  31.69 
 
 		 894 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  29.07 
 
 		 926 aa  276  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  38 
 
 		 891 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  35.97 
 
 		 946 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  29.11 
 
 		 870 aa  266  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  37 
 
 		 719 aa  266  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>