More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0679 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  98.65 
 
 
887 aa  1717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  91.44 
 
 
882 aa  1464    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  71.03 
 
 
893 aa  1179    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  100 
 
 
887 aa  1741    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  38.69 
 
 
944 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  35.72 
 
 
870 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.79 
 
 
894 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  42.56 
 
 
1269 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  33.81 
 
 
926 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  31.96 
 
 
874 aa  379  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  32.7 
 
 
864 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  30.83 
 
 
891 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  34.39 
 
 
718 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  33.48 
 
 
694 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  33.57 
 
 
710 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  32.43 
 
 
714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.66 
 
 
718 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  33.62 
 
 
717 aa  308  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  39.02 
 
 
692 aa  302  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  33.52 
 
 
714 aa  300  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  35.73 
 
 
668 aa  300  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  32.69 
 
 
704 aa  297  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  32.53 
 
 
721 aa  296  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  35.64 
 
 
711 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  32.66 
 
 
710 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  31.9 
 
 
714 aa  290  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  38.72 
 
 
706 aa  290  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  31.38 
 
 
721 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  40.05 
 
 
710 aa  288  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  38.33 
 
 
729 aa  287  5.999999999999999e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  31.38 
 
 
721 aa  287  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  31.98 
 
 
699 aa  284  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  33.96 
 
 
717 aa  284  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  33.03 
 
 
727 aa  284  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  31 
 
 
726 aa  283  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  31.55 
 
 
716 aa  283  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  32.99 
 
 
792 aa  281  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  39.39 
 
 
688 aa  280  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  31.35 
 
 
729 aa  280  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  33.04 
 
 
547 aa  279  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  36.91 
 
 
987 aa  278  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  38.19 
 
 
683 aa  278  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  38.8 
 
 
682 aa  278  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  38.19 
 
 
683 aa  278  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  38.19 
 
 
684 aa  277  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  37.73 
 
 
685 aa  277  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.6 
 
 
684 aa  277  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  37.96 
 
 
684 aa  277  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  38.19 
 
 
684 aa  276  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  38.62 
 
 
580 aa  275  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.55 
 
 
698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.55 
 
 
698 aa  274  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  38.41 
 
 
683 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  38.41 
 
 
683 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.83 
 
 
706 aa  273  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  38.41 
 
 
683 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  32.18 
 
 
756 aa  272  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  29.97 
 
 
784 aa  272  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  29.97 
 
 
784 aa  272  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  32.15 
 
 
706 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  37.16 
 
 
683 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  36.83 
 
 
420 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  37.94 
 
 
683 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  32.5 
 
 
723 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  31.47 
 
 
719 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  37.23 
 
 
693 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  32.44 
 
 
630 aa  267  7e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  29.93 
 
 
710 aa  265  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  32.91 
 
 
636 aa  264  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  32.32 
 
 
657 aa  264  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  33.56 
 
 
655 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0540  type IV pilus secretin PilQ  34.99 
 
 
636 aa  264  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.614076  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  30.68 
 
 
715 aa  262  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  36.41 
 
 
682 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  28.72 
 
 
696 aa  259  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  37.17 
 
 
712 aa  258  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  28.68 
 
 
696 aa  257  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  36.41 
 
 
689 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  36.45 
 
 
422 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  37.06 
 
 
682 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  32.99 
 
 
642 aa  253  9.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  36.62 
 
 
420 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  36.62 
 
 
420 aa  250  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  35.11 
 
 
712 aa  246  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  36.53 
 
 
578 aa  242  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  28.75 
 
 
745 aa  239  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  32.84 
 
 
808 aa  235  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  29.94 
 
 
711 aa  232  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 
538 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  35.98 
 
 
583 aa  228  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.51 
 
 
582 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  35.08 
 
 
412 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  30.2 
 
 
715 aa  218  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  34.84 
 
 
412 aa  217  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  34.84 
 
 
412 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  34.84 
 
 
412 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  34.84 
 
 
412 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  34.66 
 
 
426 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  34.04 
 
 
424 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  35.28 
 
 
386 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>