More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0838 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  100 
 
 		 711 aa  1415    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  49.17 
 
 		 717 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  49.57 
 
 		 714 aa  631  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  49.13 
 
 		 710 aa  627  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  49.29 
 
 		 715 aa  618  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  48.37 
 
 		 721 aa  618  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  48.02 
 
 		 696 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  49.33 
 
 		 696 aa  615  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  50.07 
 
 		 712 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  47.92 
 
 		 726 aa  601  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  45.21 
 
 		 723 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  47.63 
 
 		 716 aa  601  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  45.38 
 
 		 710 aa  591  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  46.47 
 
 		 715 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  46.76 
 
 		 712 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  46.07 
 
 		 706 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  45.73 
 
 		 714 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  47.01 
 
 		 721 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  47.01 
 
 		 721 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  44.18 
 
 		 745 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  41.17 
 
 		 710 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  44.62 
 
 		 711 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  40.53 
 
 		 714 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  41.3 
 
 		 718 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  41.16 
 
 		 692 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  42.19 
 
 		 699 aa  479  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  40.17 
 
 		 729 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  40.21 
 
 		 718 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  39.46 
 
 		 706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  39.44 
 
 		 717 aa  469  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  41.99 
 
 		 710 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  36.43 
 
 		 727 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  40.34 
 
 		 694 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  36.15 
 
 		 698 aa  419  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  36.15 
 
 		 698 aa  419  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  37.24 
 
 		 704 aa  412  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  38.12 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  37.65 
 
 		 668 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.85 
 
 		 685 aa  399  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  35.89 
 
 		 683 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  35.26 
 
 		 683 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  35.26 
 
 		 683 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  35.67 
 
 		 688 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.25 
 
 		 684 aa  379  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  34.95 
 
 		 683 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  35.11 
 
 		 683 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  35.14 
 
 		 684 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  35.56 
 
 		 683 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  34.94 
 
 		 683 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  38.25 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  34.98 
 
 		 684 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  33.98 
 
 		 682 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  37.77 
 
 		 630 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  34.93 
 
 		 684 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  35.05 
 
 		 682 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.43 
 
 		 706 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  38.83 
 
 		 657 aa  365  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  33.73 
 
 		 682 aa  360  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  36.52 
 
 		 655 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  32.64 
 
 		 756 aa  355  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  36.82 
 
 		 792 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  33.03 
 
 		 689 aa  347  5e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  34.41 
 
 		 784 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  34.41 
 
 		 784 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  36.65 
 
 		 578 aa  321  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  36.75 
 
 		 580 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  43.78 
 
 		 523 aa  311  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  44.02 
 
 		 591 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  42.2 
 
 		 553 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  44.02 
 
 		 576 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  43.54 
 
 		 567 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  42.2 
 
 		 553 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  41.51 
 
 		 543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  43.54 
 
 		 575 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  43.54 
 
 		 616 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  34.44 
 
 		 547 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  43.54 
 
 		 527 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  43.54 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  43.54 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  43.54 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  43.54 
 
 		 465 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  41.06 
 
 		 543 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  41.88 
 
 		 543 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.86 
 
 		 582 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  36.3 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  41.39 
 
 		 573 aa  294  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  39.86 
 
 		 420 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  32.42 
 
 		 642 aa  287  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  39.62 
 
 		 422 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  40.19 
 
 		 420 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  29.09 
 
 		 870 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  39.72 
 
 		 420 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  30.75 
 
 		 874 aa  263  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  31.42 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  42.46 
 
 		 371 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  32.55 
 
 		 719 aa  248  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  28.49 
 
 		 944 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  29.67 
 
 		 926 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  30.3 
 
 		 894 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  32.57 
 
 		 891 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>