More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1473 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 808 aa  1604    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  28.37 
 
 		 729 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  30.82 
 
 		 711 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  29.23 
 
 		 726 aa  243  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  35.92 
 
 		 717 aa  242  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  34.63 
 
 		 718 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.49 
 
 		 718 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  34.68 
 
 		 693 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  35.32 
 
 		 710 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  34.9 
 
 		 696 aa  233  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  28.92 
 
 		 710 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  35.35 
 
 		 696 aa  231  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  28 
 
 		 716 aa  231  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  35.73 
 
 		 721 aa  230  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  37.01 
 
 		 712 aa  230  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  34.25 
 
 		 893 aa  230  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.87 
 
 		 894 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  36.03 
 
 		 711 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  34.89 
 
 		 692 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  33.12 
 
 		 715 aa  228  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  35.32 
 
 		 706 aa  228  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  37.05 
 
 		 714 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  34.27 
 
 		 887 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  34.32 
 
 		 714 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.34 
 
 		 685 aa  224  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  34.34 
 
 		 887 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  36.26 
 
 		 721 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  36.26 
 
 		 721 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  34.68 
 
 		 944 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  34.2 
 
 		 657 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  34.95 
 
 		 882 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  34.71 
 
 		 683 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  28.61 
 
 		 717 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  34.58 
 
 		 710 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  34.78 
 
 		 870 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  33.64 
 
 		 682 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  30.89 
 
 		 891 aa  218  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  33.13 
 
 		 636 aa  218  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  33.7 
 
 		 704 aa  217  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  34.15 
 
 		 689 aa  217  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.29 
 
 		 874 aa  217  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  33.33 
 
 		 655 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  34.57 
 
 		 706 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  34.07 
 
 		 710 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  31.92 
 
 		 712 aa  215  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  33.49 
 
 		 683 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  35.45 
 
 		 591 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  33.19 
 
 		 714 aa  214  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  34.17 
 
 		 719 aa  214  7e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  33.09 
 
 		 575 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  33.26 
 
 		 1269 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 668 aa  213  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.87 
 
 		 684 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  32.97 
 
 		 616 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  34.25 
 
 		 688 aa  213  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  32.73 
 
 		 630 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  32.97 
 
 		 527 aa  211  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.57 
 
 		 698 aa  210  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.57 
 
 		 698 aa  210  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  33.18 
 
 		 684 aa  210  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  33.26 
 
 		 684 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  33.26 
 
 		 684 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  33.41 
 
 		 682 aa  208  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  33.18 
 
 		 580 aa  208  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  33.33 
 
 		 683 aa  206  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  32.88 
 
 		 578 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  34.51 
 
 		 567 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  34.22 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  34.22 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  34.22 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0540  type IV pilus secretin PilQ  31.75 
 
 		 636 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.614076  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  32.28 
 
 		 683 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  32.28 
 
 		 683 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  32.28 
 
 		 683 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  32.05 
 
 		 683 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  33.55 
 
 		 465 aa  204  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  32.63 
 
 		 420 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  33.04 
 
 		 547 aa  203  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  33.72 
 
 		 682 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  33.64 
 
 		 694 aa  203  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  35.63 
 
 		 543 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  34.37 
 
 		 576 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  32.87 
 
 		 699 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  35.6 
 
 		 543 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  27.69 
 
 		 745 aa  200  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  30.95 
 
 		 987 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  32.54 
 
 		 946 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  32.3 
 
 		 926 aa  198  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  35.15 
 
 		 573 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  25.66 
 
 		 727 aa  194  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  35.38 
 
 		 553 aa  194  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  32.49 
 
 		 706 aa  193  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  31.95 
 
 		 723 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  32.16 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  31.32 
 
 		 792 aa  192  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  30.42 
 
 		 642 aa  191  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  34.98 
 
 		 553 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  31.48 
 
 		 523 aa  191  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  30.86 
 
 		 420 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  33.77 
 
 		 715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>