More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0252 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  100 
 
 		 1269 aa  2498    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  43.63 
 
 		 893 aa  433  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  42.39 
 
 		 887 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  42.74 
 
 		 882 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  42.22 
 
 		 887 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  35.06 
 
 		 944 aa  336  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  36.13 
 
 		 870 aa  322  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.4 
 
 		 894 aa  312  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  34.58 
 
 		 946 aa  311  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  34.35 
 
 		 926 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  33.88 
 
 		 864 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  32.83 
 
 		 714 aa  271  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  35.89 
 
 		 891 aa  263  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  31.2 
 
 		 721 aa  262  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  30.9 
 
 		 723 aa  262  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  31.2 
 
 		 721 aa  262  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.55 
 
 		 874 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  30.98 
 
 		 710 aa  260  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  32.72 
 
 		 694 aa  260  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  30.77 
 
 		 706 aa  259  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  36.9 
 
 		 729 aa  259  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  30.42 
 
 		 710 aa  258  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  31.01 
 
 		 721 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  31.09 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  33.85 
 
 		 668 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.27 
 
 		 698 aa  256  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.27 
 
 		 698 aa  256  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  31.55 
 
 		 712 aa  252  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  30.99 
 
 		 717 aa  251  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  30.21 
 
 		 696 aa  250  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  34.35 
 
 		 718 aa  249  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  30.05 
 
 		 696 aa  249  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  32.02 
 
 		 699 aa  248  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  32.33 
 
 		 716 aa  246  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  35.62 
 
 		 987 aa  245  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.95 
 
 		 718 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  37.18 
 
 		 580 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  29.66 
 
 		 726 aa  241  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  34.26 
 
 		 692 aa  240  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  36.38 
 
 		 715 aa  239  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  30.65 
 
 		 706 aa  237  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  37.74 
 
 		 547 aa  236  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  35.7 
 
 		 710 aa  235  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.84 
 
 		 685 aa  235  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  34.75 
 
 		 717 aa  234  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  35.51 
 
 		 683 aa  234  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  36.56 
 
 		 683 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.47 
 
 		 706 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  36.56 
 
 		 683 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  36.56 
 
 		 683 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  34.79 
 
 		 712 aa  232  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  34.35 
 
 		 704 aa  232  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  35.92 
 
 		 683 aa  231  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  30.5 
 
 		 655 aa  231  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  36.17 
 
 		 683 aa  231  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  29.76 
 
 		 657 aa  231  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  30.76 
 
 		 711 aa  230  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  30.1 
 
 		 684 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  30.1 
 
 		 684 aa  229  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  35.92 
 
 		 682 aa  229  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  36.92 
 
 		 422 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.92 
 
 		 684 aa  227  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  29.93 
 
 		 684 aa  227  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  34.47 
 
 		 710 aa  227  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  35.68 
 
 		 719 aa  225  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  35.29 
 
 		 420 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  29.17 
 
 		 683 aa  224  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  34.38 
 
 		 714 aa  224  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  34.68 
 
 		 808 aa  224  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  33.18 
 
 		 689 aa  224  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  30.18 
 
 		 636 aa  224  9e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  35.8 
 
 		 682 aa  224  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  35.05 
 
 		 688 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  30.19 
 
 		 630 aa  222  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  34.91 
 
 		 578 aa  220  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1791  type II and III secretion system protein  34.38 
 
 		 524 aa  220  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.561359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1027  type II and III secretion system protein  33.12 
 
 		 552 aa  219  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  29.88 
 
 		 711 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0540  type IV pilus secretin PilQ  35.48 
 
 		 636 aa  211  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.614076  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  34.65 
 
 		 682 aa  211  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  35.06 
 
 		 420 aa  211  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  32.01 
 
 		 693 aa  210  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  30.56 
 
 		 784 aa  210  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  31.58 
 
 		 727 aa  211  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  30.56 
 
 		 784 aa  210  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  34.82 
 
 		 420 aa  208  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  29.57 
 
 		 745 aa  207  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  28.02 
 
 		 729 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  32.75 
 
 		 756 aa  206  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  32.64 
 
 		 792 aa  205  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0214  type II and III secretion system secretin  27.61 
 
 		 715 aa  204  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00866012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  32.78 
 
 		 538 aa  199  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0735  type II and III secretion system protein  32.29 
 
 		 509 aa  196  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  32.01 
 
 		 642 aa  188  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  34.29 
 
 		 412 aa  184  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  35.11 
 
 		 426 aa  183  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  34.21 
 
 		 412 aa  183  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  34.21 
 
 		 412 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  35.37 
 
 		 426 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  34.05 
 
 		 412 aa  182  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>