More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0540 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0540  type IV pilus secretin PilQ  100 
 
 		 636 aa  1293    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.614076  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  35.2 
 
 		 987 aa  281  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  32.56 
 
 		 874 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.99 
 
 		 894 aa  263  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  35.13 
 
 		 887 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  36.3 
 
 		 946 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  35.13 
 
 		 887 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  35.57 
 
 		 882 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  34.37 
 
 		 944 aa  259  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  35.6 
 
 		 926 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  37.29 
 
 		 870 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  37.04 
 
 		 580 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  36.43 
 
 		 547 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  33.86 
 
 		 893 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  35.17 
 
 		 891 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  37.44 
 
 		 689 aa  250  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  34.73 
 
 		 719 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  32.82 
 
 		 693 aa  243  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.45 
 
 		 684 aa  243  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  36.38 
 
 		 684 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  36.38 
 
 		 684 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  36.15 
 
 		 684 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  35.76 
 
 		 682 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  34.28 
 
 		 729 aa  240  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  35.29 
 
 		 685 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  35.45 
 
 		 683 aa  239  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  35.21 
 
 		 683 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  34.77 
 
 		 706 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  35.41 
 
 		 698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  35.41 
 
 		 698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  35.56 
 
 		 694 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  36.13 
 
 		 688 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  34.98 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  35.53 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  34.98 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  34.98 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  34.59 
 
 		 682 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  33.71 
 
 		 711 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  30.68 
 
 		 683 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  35.06 
 
 		 682 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  34.35 
 
 		 578 aa  229  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  34.17 
 
 		 717 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  31.46 
 
 		 704 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  34.49 
 
 		 668 aa  226  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  32.48 
 
 		 718 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  32.48 
 
 		 718 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  34.22 
 
 		 426 aa  223  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  33.25 
 
 		 692 aa  223  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  33.26 
 
 		 710 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  32.03 
 
 		 723 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  31.47 
 
 		 808 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  32.67 
 
 		 864 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  33.02 
 
 		 712 aa  220  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  32.05 
 
 		 727 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  35.63 
 
 		 583 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  31.74 
 
 		 711 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  32.74 
 
 		 630 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  32.81 
 
 		 636 aa  217  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  33.09 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  31.69 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0252  type IV pilus secretin PilQ  32.29 
 
 		 1269 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.760209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  30.96 
 
 		 792 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  31.73 
 
 		 756 aa  214  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  32.27 
 
 		 696 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  32.27 
 
 		 696 aa  212  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  29.38 
 
 		 784 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  29.38 
 
 		 784 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  29.84 
 
 		 657 aa  209  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3109  fimbrial biogenesis protein  31.12 
 
 		 721 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  32.57 
 
 		 699 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  30.72 
 
 		 714 aa  209  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  31.65 
 
 		 717 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  31.28 
 
 		 721 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  31.64 
 
 		 716 aa  209  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  31.28 
 
 		 721 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  30.91 
 
 		 712 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  31.49 
 
 		 714 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  30.58 
 
 		 710 aa  207  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  31.12 
 
 		 710 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.85 
 
 		 582 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  33.41 
 
 		 591 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  28.7 
 
 		 710 aa  204  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  32.76 
 
 		 424 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  29.91 
 
 		 726 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  32.11 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  30.44 
 
 		 706 aa  201  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  30.28 
 
 		 715 aa  200  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  33.5 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  30.59 
 
 		 714 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  32.6 
 
 		 422 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  29.45 
 
 		 655 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  31.19 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  32.1 
 
 		 729 aa  194  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  31.74 
 
 		 616 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  31.74 
 
 		 575 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  31.74 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  31.74 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  31.74 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  31.74 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  31.74 
 
 		 465 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>