More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1035 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 1421 aa  2797    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  27.3 
 
 		 881 aa  175  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  27.43 
 
 		 870 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  31.88 
 
 		 1282 aa  148  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  26.12 
 
 		 602 aa  147  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  27.23 
 
 		 424 aa  147  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  28.17 
 
 		 760 aa  144  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  24.84 
 
 		 1302 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  32.25 
 
 		 1282 aa  144  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  27.29 
 
 		 711 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  25.83 
 
 		 424 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  29.63 
 
 		 754 aa  138  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  27.14 
 
 		 944 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  29.01 
 
 		 734 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  26.88 
 
 		 667 aa  135  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  25.55 
 
 		 926 aa  135  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  25.43 
 
 		 946 aa  134  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  44.31 
 
 		 494 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  25.06 
 
 		 433 aa  132  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  26.29 
 
 		 689 aa  132  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  26.15 
 
 		 393 aa  131  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.46 
 
 		 874 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.74 
 
 		 894 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  31.17 
 
 		 436 aa  129  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  22.47 
 
 		 462 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  22.47 
 
 		 462 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  22.47 
 
 		 462 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  26.49 
 
 		 426 aa  129  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  22.47 
 
 		 465 aa  128  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  30.43 
 
 		 436 aa  128  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  42.35 
 
 		 386 aa  128  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  28.01 
 
 		 614 aa  128  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  28.11 
 
 		 423 aa  127  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  28.65 
 
 		 789 aa  127  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  25.69 
 
 		 589 aa  127  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  28.9 
 
 		 377 aa  127  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  24.75 
 
 		 891 aa  125  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  41.52 
 
 		 451 aa  125  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  41.52 
 
 		 451 aa  125  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  27.83 
 
 		 683 aa  125  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  22.22 
 
 		 523 aa  125  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  27.3 
 
 		 657 aa  125  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  33.62 
 
 		 466 aa  125  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  24.69 
 
 		 668 aa  124  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  24.33 
 
 		 578 aa  124  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  25.63 
 
 		 683 aa  125  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  26.88 
 
 		 683 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  24.59 
 
 		 698 aa  124  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  24.59 
 
 		 698 aa  124  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  26.88 
 
 		 683 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  26.88 
 
 		 683 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  26.88 
 
 		 683 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  27.4 
 
 		 682 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  25.17 
 
 		 864 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  24.58 
 
 		 688 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  25.4 
 
 		 547 aa  123  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  25.84 
 
 		 684 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  34.65 
 
 		 444 aa  123  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  30.45 
 
 		 446 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  23.71 
 
 		 413 aa  122  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  32.73 
 
 		 456 aa  122  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  25.57 
 
 		 684 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  30.73 
 
 		 449 aa  122  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  23.83 
 
 		 420 aa  122  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  25.34 
 
 		 684 aa  122  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  31.93 
 
 		 473 aa  122  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  23.5 
 
 		 576 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  27.32 
 
 		 387 aa  121  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  23.23 
 
 		 527 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  23.9 
 
 		 420 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  33.19 
 
 		 464 aa  121  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.27 
 
 		 684 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  31.98 
 
 		 469 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  35.37 
 
 		 466 aa  120  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  25.13 
 
 		 422 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  23.23 
 
 		 575 aa  119  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.23 
 
 		 685 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  25.79 
 
 		 386 aa  119  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  37.28 
 
 		 461 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  26.08 
 
 		 683 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  23.32 
 
 		 420 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  23.23 
 
 		 616 aa  119  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  26.79 
 
 		 387 aa  119  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  25.79 
 
 		 412 aa  119  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  22.11 
 
 		 591 aa  119  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  39.44 
 
 		 1519 aa  118  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  25.79 
 
 		 412 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  25.79 
 
 		 412 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  31.75 
 
 		 763 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  23.79 
 
 		 699 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  31.05 
 
 		 457 aa  117  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  25.79 
 
 		 412 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  24.62 
 
 		 745 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 580 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  33.66 
 
 		 432 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  33.66 
 
 		 441 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  33.66 
 
 		 432 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  33.66 
 
 		 441 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  33.66 
 
 		 432 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  31.82 
 
 		 454 aa  117  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>