More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1265 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 1519 aa  2994    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  28.31 
 
 		 1302 aa  293  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0859  type II and III secretion system protein  34.9 
 
 		 1282 aa  196  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0159294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0836  type II and III secretion system protein  34.11 
 
 		 1282 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  38.36 
 
 		 451 aa  119  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  39.44 
 
 		 1421 aa  118  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  38.36 
 
 		 451 aa  118  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  38.99 
 
 		 386 aa  115  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  37.95 
 
 		 494 aa  110  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  40.24 
 
 		 881 aa  108  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  31.11 
 
 		 874 aa  104  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  35.03 
 
 		 466 aa  103  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  36.81 
 
 		 672 aa  102  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  38.06 
 
 		 697 aa  101  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  39.1 
 
 		 675 aa  100  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  37.5 
 
 		 799 aa  100  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  32.11 
 
 		 657 aa  100  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  37.18 
 
 		 658 aa  100  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  31.25 
 
 		 787 aa  100  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  37.42 
 
 		 681 aa  99.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1207  type II and III secretion system protein  36.42 
 
 		 248 aa  99.4  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000846866  hitchhiker  0.00000000000000291696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  37.58 
 
 		 893 aa  99  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  28.37 
 
 		 718 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  33.13 
 
 		 602 aa  97.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  39.62 
 
 		 423 aa  97.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.37 
 
 		 718 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  34.1 
 
 		 662 aa  97.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  30.63 
 
 		 492 aa  97.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  36.36 
 
 		 689 aa  96.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  32.92 
 
 		 478 aa  95.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  32.92 
 
 		 478 aa  95.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  30.23 
 
 		 454 aa  95.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  29.39 
 
 		 431 aa  95.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  34.52 
 
 		 740 aa  95.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  30.23 
 
 		 454 aa  95.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  32.69 
 
 		 699 aa  95.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  22.5 
 
 		 420 aa  95.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  22.92 
 
 		 547 aa  95.5  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  38.71 
 
 		 436 aa  95.1  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  38.46 
 
 		 674 aa  94.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  26.59 
 
 		 493 aa  94.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  33.88 
 
 		 477 aa  94.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  30.77 
 
 		 420 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  27.71 
 
 		 454 aa  94.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  38.71 
 
 		 436 aa  94  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 484 aa  94  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  32.28 
 
 		 711 aa  94  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  28.15 
 
 		 635 aa  93.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  32.62 
 
 		 495 aa  93.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  38 
 
 		 443 aa  93.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  32.5 
 
 		 479 aa  92.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  32.95 
 
 		 946 aa  93.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  33.12 
 
 		 717 aa  93.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  36.54 
 
 		 445 aa  92.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  32.37 
 
 		 926 aa  92.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  34.59 
 
 		 482 aa  92  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  29.15 
 
 		 408 aa  92  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  33.95 
 
 		 496 aa  91.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  32.48 
 
 		 714 aa  91.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  34.2 
 
 		 641 aa  91.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  23.23 
 
 		 420 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  38.99 
 
 		 882 aa  91.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  38.99 
 
 		 887 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 682 aa  91.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  32.28 
 
 		 894 aa  90.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  38.99 
 
 		 887 aa  90.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  27.86 
 
 		 692 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  26.26 
 
 		 870 aa  90.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  23.43 
 
 		 580 aa  89.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  28.48 
 
 		 630 aa  89.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  31.58 
 
 		 944 aa  89.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  34.91 
 
 		 747 aa  89.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  28.46 
 
 		 416 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  32.92 
 
 		 452 aa  89.4  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  28.03 
 
 		 422 aa  89.4  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  31.88 
 
 		 727 aa  89  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1406  type II and III secretion system protein  35.22 
 
 		 538 aa  88.6  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.7882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  31.58 
 
 		 738 aa  88.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  32.48 
 
 		 710 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  34.73 
 
 		 663 aa  88.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.74 
 
 		 706 aa  87.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0639  type II and III secretion system protein  38.32 
 
 		 596 aa  87.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  34.32 
 
 		 702 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2920  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  33.54 
 
 		 595 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  31.55 
 
 		 781 aa  87.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  33.54 
 
 		 474 aa  88.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  31.55 
 
 		 781 aa  87.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  25.47 
 
 		 745 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2851  type II and III secretion system protein  39.37 
 
 		 895 aa  87.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17629  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  27.71 
 
 		 461 aa  87  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  31.1 
 
 		 461 aa  87  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  27.57 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6875  type II and III secretion system protein  33.54 
 
 		 561 aa  87  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  31.71 
 
 		 698 aa  86.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  32.69 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  32.72 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  32.72 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  24.81 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  29.21 
 
 		 915 aa  86.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  29.84 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>