More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06090 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 881 aa  1746    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  27.36 
 
 		 1421 aa  181  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  25.3 
 
 		 602 aa  153  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  37.05 
 
 		 657 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  31.99 
 
 		 641 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  39.44 
 
 		 507 aa  134  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.36 
 
 		 662 aa  134  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  41.14 
 
 		 484 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  38.42 
 
 		 493 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  40.12 
 
 		 457 aa  126  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  40.23 
 
 		 494 aa  125  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  36.84 
 
 		 482 aa  125  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  24.59 
 
 		 635 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  37.93 
 
 		 454 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  37.93 
 
 		 454 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  33.47 
 
 		 679 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  22.21 
 
 		 724 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  24.26 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  41.04 
 
 		 517 aa  123  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  31.02 
 
 		 482 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  36.51 
 
 		 419 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  36.99 
 
 		 530 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  33.6 
 
 		 663 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  35.83 
 
 		 466 aa  121  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  24.01 
 
 		 703 aa  121  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  36.67 
 
 		 451 aa  121  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  36.99 
 
 		 496 aa  121  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  36.67 
 
 		 451 aa  121  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  35.29 
 
 		 468 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  35.71 
 
 		 657 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  40 
 
 		 526 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  33.06 
 
 		 690 aa  120  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  33.06 
 
 		 690 aa  120  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  33.06 
 
 		 690 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  23.04 
 
 		 714 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  35.71 
 
 		 656 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  32.4 
 
 		 620 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  32.83 
 
 		 734 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  22.86 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  28.71 
 
 		 781 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  29.18 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  27.34 
 
 		 439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  26.85 
 
 		 870 aa  119  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  34.83 
 
 		 408 aa  119  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  23.05 
 
 		 681 aa  119  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  35.29 
 
 		 454 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  25.32 
 
 		 681 aa  119  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  26.93 
 
 		 633 aa  118  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  34.04 
 
 		 416 aa  118  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  22.71 
 
 		 654 aa  118  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  22.71 
 
 		 654 aa  118  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  41.52 
 
 		 1519 aa  118  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  28.66 
 
 		 460 aa  118  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  30.8 
 
 		 632 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  27.76 
 
 		 699 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  33.01 
 
 		 386 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  26.46 
 
 		 673 aa  117  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  36.9 
 
 		 652 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  26.62 
 
 		 756 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  26.33 
 
 		 634 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  36.21 
 
 		 454 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 646 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  28.33 
 
 		 781 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  28.93 
 
 		 740 aa  117  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 642 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  36.99 
 
 		 492 aa  117  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 642 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  42.61 
 
 		 698 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  27 
 
 		 698 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  27 
 
 		 698 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  27.52 
 
 		 460 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  27.56 
 
 		 423 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  37.06 
 
 		 464 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  34.1 
 
 		 460 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  22.26 
 
 		 710 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  27.83 
 
 		 704 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.84 
 
 		 894 aa  115  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  22.53 
 
 		 704 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  32.05 
 
 		 422 aa  115  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  28.01 
 
 		 682 aa  115  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  27.08 
 
 		 711 aa  114  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  28.04 
 
 		 689 aa  114  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  22.85 
 
 		 703 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  22.7 
 
 		 728 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  27.04 
 
 		 926 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  24.68 
 
 		 710 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  38.65 
 
 		 446 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  38.6 
 
 		 466 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  36.13 
 
 		 689 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  31.44 
 
 		 630 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  30.94 
 
 		 445 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  22.16 
 
 		 704 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  32.05 
 
 		 696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  27.71 
 
 		 946 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  36 
 
 		 490 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  30.45 
 
 		 686 aa  113  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  22.07 
 
 		 702 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  27.8 
 
 		 944 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  23.01 
 
 		 648 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  37.28 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>