More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2072 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  100 
 
 
492 aa  986    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  48.38 
 
 
457 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  44.88 
 
 
454 aa  325  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  45.45 
 
 
444 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  45.01 
 
 
461 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  44.98 
 
 
454 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  44.98 
 
 
454 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  45.15 
 
 
468 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  45.88 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  46.56 
 
 
432 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  46.56 
 
 
432 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  46.56 
 
 
432 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  46.89 
 
 
441 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  46.89 
 
 
441 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  46.89 
 
 
441 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  46.89 
 
 
441 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  46.78 
 
 
441 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  43.68 
 
 
469 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  42.14 
 
 
443 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  44.03 
 
 
443 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  42.34 
 
 
443 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  42.34 
 
 
443 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  42.34 
 
 
443 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  42.76 
 
 
473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  42.92 
 
 
452 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  40.05 
 
 
408 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  38.89 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  38.89 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  41.49 
 
 
419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  35.89 
 
 
416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  39.1 
 
 
416 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  40.1 
 
 
422 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  36.55 
 
 
453 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  38.24 
 
 
483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  36.34 
 
 
419 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  35.42 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  34.86 
 
 
482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  35.01 
 
 
484 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  35.34 
 
 
428 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  32.55 
 
 
477 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  33.86 
 
 
490 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  32.08 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  29.25 
 
 
482 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  32.41 
 
 
487 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 
484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  38 
 
 
431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  51.48 
 
 
455 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  30.44 
 
 
514 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  36.83 
 
 
526 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  42.86 
 
 
517 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  31.52 
 
 
460 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  30.48 
 
 
493 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  50.3 
 
 
460 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  50.3 
 
 
460 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  30.07 
 
 
622 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  37.45 
 
 
539 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  42.42 
 
 
464 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  40.98 
 
 
520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  47.4 
 
 
466 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  37.98 
 
 
496 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  35.58 
 
 
571 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  31.91 
 
 
473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  34.41 
 
 
482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  34.41 
 
 
482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  34.41 
 
 
482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  34.41 
 
 
482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  34.41 
 
 
482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  34.41 
 
 
482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  34.41 
 
 
492 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  28.51 
 
 
483 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  48.52 
 
 
507 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  34.52 
 
 
479 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  32.84 
 
 
491 aa  159  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  34.17 
 
 
461 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  33.86 
 
 
461 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  34.16 
 
 
474 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  33.86 
 
 
461 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  29.62 
 
 
423 aa  156  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  39.44 
 
 
656 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  35.37 
 
 
466 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  28.97 
 
 
478 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  38.57 
 
 
657 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 
478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  32 
 
 
491 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  35.97 
 
 
633 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  34.77 
 
 
479 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  35.07 
 
 
463 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  35.92 
 
 
474 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  37.56 
 
 
652 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  35.07 
 
 
530 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  28.87 
 
 
486 aa  150  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  46.75 
 
 
700 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  38.03 
 
 
642 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  38.03 
 
 
642 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  27.85 
 
 
451 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  38.03 
 
 
646 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  42.86 
 
 
456 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  29.46 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  43.16 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  28.78 
 
 
620 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>