More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0369 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  100 
 
 		 445 aa  897    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  44.2 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  42.14 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  40.63 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  40.83 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  39.78 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  29.2 
 
 		 460 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  29.74 
 
 		 475 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  27.88 
 
 		 478 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  27.33 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  27.62 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  32.61 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  30.38 
 
 		 493 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  27.34 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  31.23 
 
 		 461 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  28.05 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  29.9 
 
 		 491 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  28.05 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  28.05 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  28.05 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  28.05 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  27.88 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  28.94 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  28.68 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  27.25 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  27.73 
 
 		 497 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  27.67 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  29.44 
 
 		 474 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  28.33 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  27.66 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  28.43 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  29.84 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  29.11 
 
 		 466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  29.2 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  27.51 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  27.34 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  25.57 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  29.75 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  28.24 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  27.58 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  30.67 
 
 		 480 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  29.41 
 
 		 480 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  28.5 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  27.49 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  27.25 
 
 		 461 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  27.25 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  27.39 
 
 		 502 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  28.81 
 
 		 574 aa  159  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  26.73 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  28.84 
 
 		 496 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  28.54 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  40.83 
 
 		 526 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  29.18 
 
 		 633 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  28.93 
 
 		 663 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  27.4 
 
 		 492 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  29.4 
 
 		 620 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  26.75 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  39.05 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  25.05 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  27.97 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  25.06 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  26.56 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  27.25 
 
 		 595 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  28.5 
 
 		 491 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  29.62 
 
 		 468 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  28.47 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  25.35 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  26.11 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  37.25 
 
 		 419 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  27.34 
 
 		 603 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  28.81 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  29.64 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  27.99 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  34.74 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  27.99 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  27.99 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  27.99 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  28.95 
 
 		 495 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  28.35 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  28.35 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  27.99 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  27.99 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  27.99 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  26.92 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  28.54 
 
 		 690 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  28.14 
 
 		 443 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  28.54 
 
 		 690 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  28.84 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  26.87 
 
 		 507 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  28.03 
 
 		 652 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  27.17 
 
 		 510 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  29.06 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  29.06 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  29.06 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  43.18 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  26.91 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  35.02 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  28.28 
 
 		 690 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  27.85 
 
 		 656 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>