More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03353 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  100 
 
 		 449 aa  909    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  65.4 
 
 		 456 aa  624  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  54.32 
 
 		 446 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  42.14 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  36.63 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  37.44 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  29.47 
 
 		 475 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  28.61 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  28.71 
 
 		 474 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  28.78 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  29.02 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  28.09 
 
 		 460 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  28.02 
 
 		 478 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  27.47 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  27.47 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  27.47 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  27.47 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  27.47 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  27.71 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  30.43 
 
 		 491 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  28.27 
 
 		 507 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  29.79 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  27.98 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  27.38 
 
 		 574 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  28.83 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  28.98 
 
 		 539 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  28.54 
 
 		 620 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  28.61 
 
 		 595 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  28.61 
 
 		 652 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 646 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  29.23 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 642 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  28.57 
 
 		 642 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  42.25 
 
 		 526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  27.15 
 
 		 514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  27.49 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  29.69 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  28.61 
 
 		 633 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  28.4 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  28.64 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  28.35 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  26.42 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  28.61 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  25.95 
 
 		 466 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  28.61 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  26.98 
 
 		 657 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  26.57 
 
 		 656 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  26.64 
 
 		 482 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  41.94 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  27.66 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  28.33 
 
 		 700 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  42.39 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  27.02 
 
 		 690 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  27.02 
 
 		 690 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  27.65 
 
 		 479 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  29.7 
 
 		 493 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  26.16 
 
 		 495 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  28.67 
 
 		 479 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  40.59 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  27.25 
 
 		 679 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  26.79 
 
 		 690 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  27.63 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  26.46 
 
 		 603 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  27.15 
 
 		 634 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  26.33 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  28.1 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  26.03 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  27.27 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  44.05 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  42.86 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  28.1 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 492 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  25.36 
 
 		 477 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  41.58 
 
 		 457 aa  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  40.56 
 
 		 454 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  26.9 
 
 		 483 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  40.56 
 
 		 454 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  27.34 
 
 		 517 aa  143  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  25.28 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  25.66 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  27.21 
 
 		 499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  26.26 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  26.47 
 
 		 499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  26.95 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  41.46 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  26.55 
 
 		 507 aa  140  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  28.3 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  43.6 
 
 		 452 aa  140  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  41.46 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  26.49 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  41.57 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  25.53 
 
 		 663 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  25.73 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  41.32 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  26.88 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  39.02 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>