More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1642 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  100 
 
 
453 aa  911    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  44.07 
 
 
483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  40.84 
 
 
408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  41.3 
 
 
416 aa  299  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  41.71 
 
 
428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  40.44 
 
 
419 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  39.07 
 
 
419 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  37.26 
 
 
416 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  40.98 
 
 
444 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  40.65 
 
 
468 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  40.45 
 
 
441 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  40.45 
 
 
432 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  40.45 
 
 
441 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  40.45 
 
 
432 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  40.45 
 
 
441 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  40.45 
 
 
441 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  40.45 
 
 
432 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  38.53 
 
 
422 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  40.84 
 
 
461 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  40.45 
 
 
441 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  42.49 
 
 
443 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  38.41 
 
 
454 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  38.41 
 
 
454 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  40.25 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  38.04 
 
 
473 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  39.75 
 
 
443 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  40.25 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  40.25 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  40.25 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  38.31 
 
 
454 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  37.69 
 
 
469 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  40.39 
 
 
478 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  40.39 
 
 
478 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  38.66 
 
 
457 aa  236  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  36.03 
 
 
492 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  36.51 
 
 
452 aa  230  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  35.05 
 
 
461 aa  226  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  34.76 
 
 
477 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  33.26 
 
 
482 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  32.85 
 
 
482 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  33.64 
 
 
490 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  34.57 
 
 
431 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  34.79 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  35.69 
 
 
460 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 
484 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  34.7 
 
 
460 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  32.86 
 
 
460 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  33.91 
 
 
493 aa  189  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  35.39 
 
 
492 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  34.95 
 
 
482 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  34.95 
 
 
482 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  34.95 
 
 
482 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  32.87 
 
 
484 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  34.95 
 
 
482 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  34.95 
 
 
482 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  34.95 
 
 
482 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  32.65 
 
 
487 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  31.17 
 
 
493 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  29.48 
 
 
496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  32.93 
 
 
478 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  31.46 
 
 
464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.54 
 
 
483 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  30.27 
 
 
526 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  31.19 
 
 
530 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  30.84 
 
 
486 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  32.76 
 
 
463 aa  179  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  30 
 
 
466 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  31.48 
 
 
479 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  31.88 
 
 
517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  31.48 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  32.26 
 
 
479 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  35.45 
 
 
520 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 
480 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 
475 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  31.89 
 
 
461 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  32.04 
 
 
491 aa  169  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  32.31 
 
 
474 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  31.92 
 
 
480 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  31.53 
 
 
491 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  29.38 
 
 
491 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  31.5 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  31.57 
 
 
461 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  48.24 
 
 
539 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  29.8 
 
 
574 aa  163  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  28.44 
 
 
514 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  29.86 
 
 
474 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  31.6 
 
 
504 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  29.64 
 
 
499 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  29.86 
 
 
493 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 
502 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  30 
 
 
571 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  30.75 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  29.8 
 
 
489 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  29.05 
 
 
507 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  30.04 
 
 
657 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  31.65 
 
 
546 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  28.12 
 
 
620 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  29.64 
 
 
652 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  29.74 
 
 
646 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>