More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4871 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  100 
 
 		 408 aa  816    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  94.06 
 
 		 416 aa  710    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  58.54 
 
 		 416 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  58.73 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  57.55 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  53.25 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  51.86 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  47.85 
 
 		 483 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  41.07 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  43.96 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  41.97 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  41.97 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  41.56 
 
 		 454 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  38.74 
 
 		 469 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  39.85 
 
 		 473 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  38.91 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  39.53 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  40.54 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  40.05 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  39.02 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  39.02 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  39.6 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  39.02 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  38.59 
 
 		 468 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  41.86 
 
 		 452 aa  229  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  36.78 
 
 		 478 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  36.78 
 
 		 478 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  39.12 
 
 		 461 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  36.83 
 
 		 443 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  35.37 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  34.17 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  35.49 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  33.82 
 
 		 482 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  34.7 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  32.85 
 
 		 493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  41.46 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  34.28 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  35.15 
 
 		 460 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  35.26 
 
 		 461 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  33.49 
 
 		 496 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  33.97 
 
 		 461 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.6 
 
 		 460 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  40.36 
 
 		 493 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  35.26 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  31.53 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  33.8 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  43.41 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  32.47 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  31.21 
 
 		 526 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  34.36 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  34.36 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  34.36 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  34.36 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  34.36 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  32.73 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  34.36 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  34.28 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  32.78 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  32.41 
 
 		 478 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  32.78 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  37.45 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  36.81 
 
 		 571 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  37.94 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  32.63 
 
 		 483 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  39.1 
 
 		 507 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 474 aa  166  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  44.1 
 
 		 530 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  36.56 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  38.78 
 
 		 657 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  39.02 
 
 		 656 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  37.16 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  38.31 
 
 		 646 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  38.31 
 
 		 642 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  38.31 
 
 		 642 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  36.3 
 
 		 620 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  39.93 
 
 		 634 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  39.46 
 
 		 690 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  30.13 
 
 		 603 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  37.17 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  30.6 
 
 		 652 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  36.76 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  33.79 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  38.06 
 
 		 679 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  31.36 
 
 		 497 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  32.56 
 
 		 463 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  38.22 
 
 		 700 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  40.38 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  30.95 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  41.35 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  45.66 
 
 		 491 aa  152  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>