More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0685 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  97.39 
 
 		 439 aa  828    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 423 aa  852    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  40.83 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  38.18 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  37.61 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  37.44 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  30.02 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  29.28 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  29.2 
 
 		 474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  28.93 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  28.93 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  28.17 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  25.71 
 
 		 463 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  28.44 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  28.86 
 
 		 461 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  30.62 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  28.61 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  26.89 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  28.5 
 
 		 461 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  26.72 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  28.37 
 
 		 482 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  26.25 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  26.25 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  27.9 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  25.8 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  25.8 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  25.8 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  29.13 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  27.76 
 
 		 490 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  27.6 
 
 		 473 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  28.54 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  27.45 
 
 		 491 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  32.42 
 
 		 457 aa  156  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  28.88 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  27.1 
 
 		 496 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  28.37 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  29.97 
 
 		 497 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  28.99 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  38.57 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  26.16 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  28.16 
 
 		 466 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  27.01 
 
 		 480 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  27.06 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  28.54 
 
 		 461 aa  149  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  40.2 
 
 		 416 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  25.73 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  26.67 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  25.36 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  26.47 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  27.19 
 
 		 620 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  24.77 
 
 		 495 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  42.13 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  26.78 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  24.7 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  28.07 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  27.41 
 
 		 520 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  39.68 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  26.28 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  40 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  42.37 
 
 		 419 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  26.76 
 
 		 512 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  26.72 
 
 		 501 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  26 
 
 		 530 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  28.15 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  43.37 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  42.77 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  42.6 
 
 		 422 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  30.1 
 
 		 478 aa  140  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  30.1 
 
 		 478 aa  140  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  25.36 
 
 		 493 aa  139  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  43.37 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  43.37 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  43.37 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  26.25 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  42.77 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  42.77 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  42.77 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  42.77 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  42.77 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  42.77 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  25.18 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  27.29 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  42.77 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  41.43 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  27.29 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  40.22 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  33.59 
 
 		 646 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  45.4 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  33.59 
 
 		 642 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  33.59 
 
 		 642 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  24.82 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  25.62 
 
 		 507 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  33.21 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 656 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  26.77 
 
 		 633 aa  136  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  28.54 
 
 		 468 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  25.64 
 
 		 574 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  32.46 
 
 		 657 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>