More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2042 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 474 aa  951    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  68.3 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  67.71 
 
 		 478 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  56.25 
 
 		 463 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  35.68 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  36.85 
 
 		 460 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  36.1 
 
 		 460 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  37.72 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  37.47 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  37.47 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  37.47 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  37.61 
 
 		 493 aa  250  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  37.47 
 
 		 482 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  37.47 
 
 		 482 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  37.47 
 
 		 482 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.99 
 
 		 539 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  34.65 
 
 		 491 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  35 
 
 		 526 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  33.03 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  33.8 
 
 		 491 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  32.94 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  34.43 
 
 		 491 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  36.25 
 
 		 473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  34.45 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  34.69 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  31.18 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  31.75 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  32.07 
 
 		 499 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  30.73 
 
 		 502 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  31.79 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  29.68 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  30.82 
 
 		 501 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  29.23 
 
 		 439 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  34.49 
 
 		 496 aa  203  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  28.57 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  31.66 
 
 		 493 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  32.25 
 
 		 486 aa  200  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  31.22 
 
 		 492 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  31.35 
 
 		 489 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  32.26 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  33.55 
 
 		 546 aa  196  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  32.54 
 
 		 516 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  30.8 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 484 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  31.56 
 
 		 507 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  31.32 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  28.78 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  32.66 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  32.68 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  34.15 
 
 		 482 aa  183  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  31.45 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  28.4 
 
 		 446 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  29.3 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  30.33 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  30.96 
 
 		 634 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  31.35 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  29.86 
 
 		 603 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  32.73 
 
 		 466 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  29.32 
 
 		 482 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  29.55 
 
 		 507 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  27.47 
 
 		 445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  29.84 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  29.66 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  30.37 
 
 		 461 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  31.98 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  30.37 
 
 		 461 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  41.44 
 
 		 454 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  41.44 
 
 		 454 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  30.39 
 
 		 466 aa  169  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  31.7 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  30.66 
 
 		 620 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 486 aa  166  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  37.77 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  37.71 
 
 		 422 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  30.92 
 
 		 530 aa  163  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  39.22 
 
 		 483 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  29.93 
 
 		 595 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  30.85 
 
 		 642 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  30.85 
 
 		 642 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  30.85 
 
 		 646 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  38.37 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 416 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  39.84 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 		 663 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  36.73 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  29.53 
 
 		 652 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  31.19 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  29.6 
 
 		 571 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  29.63 
 
 		 622 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  29 
 
 		 633 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  28.44 
 
 		 478 aa  156  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  28.47 
 
 		 490 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 441 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  29.35 
 
 		 656 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 441 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  39.31 
 
 		 441 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  26.77 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>