More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0793 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 571 aa  1130    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  42.64 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  48.73 
 
 		 504 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  40.07 
 
 		 700 aa  347  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  39.61 
 
 		 603 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  39.44 
 
 		 634 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  39.37 
 
 		 620 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  37.61 
 
 		 574 aa  324  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  40.12 
 
 		 633 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  38.07 
 
 		 663 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  39.23 
 
 		 642 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  39.23 
 
 		 646 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  39.23 
 
 		 642 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  39.08 
 
 		 657 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  39.15 
 
 		 652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  38.96 
 
 		 656 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  38.96 
 
 		 679 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  38.43 
 
 		 690 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  38.43 
 
 		 690 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  38.12 
 
 		 690 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  36.28 
 
 		 482 aa  283  7.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  36.02 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  37.24 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  37.24 
 
 		 493 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  35.06 
 
 		 478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  56.31 
 
 		 595 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 486 aa  229  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  33.67 
 
 		 483 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  36.36 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  36.57 
 
 		 526 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  34.88 
 
 		 460 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  35.78 
 
 		 461 aa  207  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  35.12 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  35.09 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  33.04 
 
 		 491 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  35.09 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  32.87 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  34.93 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.88 
 
 		 460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.86 
 
 		 539 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  32.32 
 
 		 496 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  34.16 
 
 		 492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  31.8 
 
 		 530 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  35.04 
 
 		 495 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  34.59 
 
 		 474 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  32.35 
 
 		 464 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  33.09 
 
 		 477 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  34.22 
 
 		 466 aa  193  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  33.56 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  33.56 
 
 		 482 aa  190  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  33.56 
 
 		 482 aa  190  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  33.56 
 
 		 482 aa  190  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  33.56 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  33.56 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  31.81 
 
 		 499 aa  189  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  31.59 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  33.99 
 
 		 487 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  34.39 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  30.91 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  33.11 
 
 		 493 aa  183  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  32.89 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  29.23 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  32.03 
 
 		 497 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  34.21 
 
 		 451 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  32.6 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  32.14 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  32.37 
 
 		 622 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  33.71 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  29.02 
 
 		 510 aa  178  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  32.69 
 
 		 494 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  34.98 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  30.91 
 
 		 479 aa  177  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  30.48 
 
 		 501 aa  177  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  29.28 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  30.97 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  42.6 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  33.25 
 
 		 451 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  32.42 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  34.38 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  30.32 
 
 		 502 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  33.86 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  33.63 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  33.63 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  33.63 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  29.65 
 
 		 480 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  33.63 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  33.63 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  33.63 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  33.63 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  38.54 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  31.74 
 
 		 507 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  30.66 
 
 		 546 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  31.24 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  30.17 
 
 		 516 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  33.11 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  32.37 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>