More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0799 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  100 
 
 
486 aa  965    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  69.91 
 
 
461 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  50.39 
 
 
510 aa  455  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  36.29 
 
 
514 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  36.3 
 
 
633 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  36.01 
 
 
620 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  35.87 
 
 
603 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  36.85 
 
 
634 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  36.09 
 
 
700 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  36.29 
 
 
595 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  34.27 
 
 
642 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  34.27 
 
 
642 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  34.92 
 
 
646 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  31.47 
 
 
571 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  33.19 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  33.19 
 
 
657 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  43.84 
 
 
574 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  31.64 
 
 
504 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  31.67 
 
 
484 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  33.95 
 
 
482 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.61 
 
 
478 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  31.24 
 
 
493 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  30.97 
 
 
483 aa  200  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  40.35 
 
 
656 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  40.77 
 
 
652 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  41.18 
 
 
690 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  41.18 
 
 
690 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  40.48 
 
 
679 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  30.63 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  31.03 
 
 
516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  30.11 
 
 
466 aa  173  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  30.21 
 
 
461 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 
491 aa  169  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  30.53 
 
 
461 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  30.21 
 
 
496 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  30.26 
 
 
525 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  30.72 
 
 
524 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  31.15 
 
 
507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  28.32 
 
 
455 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  36.86 
 
 
491 aa  166  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  28.89 
 
 
494 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  30.82 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  31.65 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  31.65 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  31.65 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  31.65 
 
 
482 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  31.65 
 
 
482 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  31.65 
 
 
482 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  28.31 
 
 
460 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  31.32 
 
 
499 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  28.6 
 
 
487 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  29.25 
 
 
507 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  29.67 
 
 
475 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  28.91 
 
 
460 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  28.75 
 
 
486 aa  160  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  28.85 
 
 
474 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  30.65 
 
 
499 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  30.05 
 
 
512 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  30.09 
 
 
478 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  27.45 
 
 
501 aa  156  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  28.63 
 
 
530 aa  156  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  28.38 
 
 
479 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  30.32 
 
 
473 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  29.52 
 
 
497 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  29.02 
 
 
473 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.55 
 
 
492 aa  148  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  29.87 
 
 
493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  34.93 
 
 
460 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  28.05 
 
 
480 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  28.01 
 
 
491 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  26.51 
 
 
489 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  31.1 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0369  type II/III secretion system protein  26.71 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.117344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  26.75 
 
 
493 aa  141  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  33.46 
 
 
466 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  28.78 
 
 
526 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  35.35 
 
 
495 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  33.78 
 
 
477 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  36.54 
 
 
474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03353  Flp pilus assembly protein secretin  25.65 
 
 
449 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  30.5 
 
 
454 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.81 
 
 
539 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  33.93 
 
 
483 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  27.19 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  27.04 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  26.27 
 
 
502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  34.04 
 
 
497 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0605  type II and III secretion system protein  24.83 
 
 
446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  23.45 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  31.54 
 
 
517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06196  Flp pilus assembly protein, secretin CapC  26.08 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  26.48 
 
 
464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  26.19 
 
 
502 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  32.46 
 
 
479 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  23.25 
 
 
439 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  33.22 
 
 
457 aa  127  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  31.62 
 
 
454 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  31.62 
 
 
454 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  33.98 
 
 
454 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  33.57 
 
 
408 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>