More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0305 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  92.62 
 
 		 461 aa  842    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  92.84 
 
 		 461 aa  845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 461 aa  920    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  69.49 
 
 		 474 aa  608  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  66.44 
 
 		 497 aa  588  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  61.25 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  45.67 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  42.82 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  41.12 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  40.05 
 
 		 482 aa  309  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  43.07 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  41.15 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  37.98 
 
 		 496 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  36.85 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  40.59 
 
 		 464 aa  276  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  38.44 
 
 		 491 aa  269  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  37.32 
 
 		 478 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  37.92 
 
 		 530 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  40 
 
 		 479 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  35.68 
 
 		 490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  37.39 
 
 		 495 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  35.78 
 
 		 477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  36.9 
 
 		 491 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  36.72 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  37.2 
 
 		 620 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  36.09 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  36.7 
 
 		 663 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  36.64 
 
 		 633 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  35.87 
 
 		 460 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  35.05 
 
 		 479 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  36.15 
 
 		 480 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  34.19 
 
 		 486 aa  237  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  36.86 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  36.23 
 
 		 514 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  34.12 
 
 		 574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  34.64 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  38.02 
 
 		 484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  37.84 
 
 		 507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  37.39 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  32.32 
 
 		 525 aa  232  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  35.1 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  34.89 
 
 		 480 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  35.17 
 
 		 524 aa  229  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  32.53 
 
 		 545 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  36.26 
 
 		 679 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  34.11 
 
 		 652 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  34.24 
 
 		 646 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  34.24 
 
 		 642 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  34.24 
 
 		 642 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  33.72 
 
 		 656 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  33.19 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 		 657 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 690 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  34.78 
 
 		 690 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  35.07 
 
 		 690 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  32.64 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 455 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  33.19 
 
 		 499 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  32.89 
 
 		 494 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  30.98 
 
 		 507 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  34.65 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.75 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  32.06 
 
 		 502 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  31.72 
 
 		 502 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  35.52 
 
 		 473 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  34.43 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  34.43 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  34.43 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  32.15 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  34.43 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  34.43 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  32.97 
 
 		 512 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  32.98 
 
 		 516 aa  213  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  33.17 
 
 		 489 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  36.01 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 		 526 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  33.04 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  33.12 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  35.78 
 
 		 571 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  32.37 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  31.53 
 
 		 603 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  31.33 
 
 		 595 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  30.77 
 
 		 634 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  30.22 
 
 		 700 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  33.69 
 
 		 494 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  34.62 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  32.91 
 
 		 622 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  41.22 
 
 		 408 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  33.56 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  31.02 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  33.06 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  38.38 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  29.55 
 
 		 520 aa  180  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  33.33 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  38.52 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  30.18 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  39.03 
 
 		 422 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>