More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2703 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 499 aa  987    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  88.14 
 
 		 502 aa  843    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  84.19 
 
 		 502 aa  815    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  67.67 
 
 		 501 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  68.19 
 
 		 494 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  63.23 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  46.54 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  45.76 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  45.59 
 
 		 493 aa  382  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  44.7 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  44.04 
 
 		 489 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  45.92 
 
 		 492 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  45.93 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  43.03 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  41.32 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  40.21 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4193  type II and III secretion system protein  37.2 
 
 		 545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  38.3 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  38.19 
 
 		 507 aa  299  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  36.47 
 
 		 525 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  37.26 
 
 		 524 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  36.98 
 
 		 512 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  35.36 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  33.97 
 
 		 499 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  33.85 
 
 		 493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  34.24 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.65 
 
 		 539 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  36.36 
 
 		 460 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  33.04 
 
 		 461 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  35.65 
 
 		 460 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  32.81 
 
 		 461 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  33.88 
 
 		 493 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  33.03 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  35.7 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  37.53 
 
 		 482 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  37.53 
 
 		 482 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  37.53 
 
 		 482 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  37.53 
 
 		 482 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  37.53 
 
 		 482 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  37.53 
 
 		 482 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.49 
 
 		 492 aa  223  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  32.64 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  33.11 
 
 		 487 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  31.19 
 
 		 483 aa  217  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  35.27 
 
 		 620 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  31.62 
 
 		 466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  31.3 
 
 		 497 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  34.5 
 
 		 663 aa  210  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.28 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 595 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  32.05 
 
 		 491 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  31.63 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  34.89 
 
 		 642 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  34.89 
 
 		 642 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  32.4 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  34.89 
 
 		 646 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  31.24 
 
 		 603 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  32.36 
 
 		 478 aa  202  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  31.92 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  36.19 
 
 		 690 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  36.19 
 
 		 690 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  33.56 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  33.25 
 
 		 652 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  35.38 
 
 		 690 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  31.18 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  36.21 
 
 		 679 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  31.87 
 
 		 514 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  31.51 
 
 		 634 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  31.74 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  34.1 
 
 		 657 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  35.59 
 
 		 633 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  34.11 
 
 		 656 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  31.24 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  29.74 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  31.72 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  31.81 
 
 		 571 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  30.25 
 
 		 496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  34.31 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 		 466 aa  183  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  28.91 
 
 		 477 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  32.21 
 
 		 574 aa  181  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  30.36 
 
 		 700 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  33.96 
 
 		 443 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  32.61 
 
 		 461 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  32.66 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  32.66 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  32.66 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  34.22 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  34.22 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  34.22 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  34.22 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  34.22 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  34.22 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  34.22 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  33.98 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  32.45 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  29.45 
 
 		 490 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  30.37 
 
 		 495 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>